Marokko war ein französisches Protektorat und wurde von der Vichy-Regierung regiert, obwohl der Sultan von Marokko der offizielle Herrscher war. Sie waren nicht sehr in den Krieg verwickelt, die Franzosen waren ziemlich dünn am Boden, und Algerien war ihr Hauptbesitz in Nordafrika, während die Marokkaner wenig am Krieg beteiligt waren und das französische Protektorat ablehnten.
Im August 1941 erließ die Vichy-Regierung von Frankreich Gesetze, die marokkanische Juden diskriminierten. Es setzte Quoten für die Anzahl jüdischer Ärzte und Anwälte fest, warf Schüler aus französischen Schulen aus und zwang viele Juden, die in den europäischen Vierteln lebten, in die Mellahs (traditionelle jüdische Viertel) zu ziehen.
Der marokkanische Sultan Mohammed V. sagte den jüdischen Führern, dass seiner Meinung nach die Vichy-Gesetze, die die Juden herausgreifen, mit dem marokkanischen Recht unvereinbar seien. Er glaubte, dass Juden mit Muslimen gleich behandelt werden sollten. Er betonte, dass das Eigentum und das Leben der Juden unter seinem Schutz blieben. Aufgrund seiner starken Haltung setzten die Vichy-Administratoren die diskriminierenden Gesetze und Vorschriften nicht energisch um.
Als die Alliierten 1942 landeten, ergab sich die Vichy-Regierung nach drei Tagen. Auf der Konferenz von Casablanca im Januar 1943 trafen sich Präsident Roosevelt, Winston Churchill, General de Gaulle, General Noguès (Vichy-Befehlshaber der französischen Truppen in Marokko und Generalresident des Protektorats) mit Sultan Mohammed V. und seinem Sohn Moulay Hassan. Der Sultan machte einen guten Eindruck auf Roosevelt, und sechs Monate später hatten Roosevelt, Churchill und der Sultan ein Treffen ohne französische Anwesenheit. Roosevelt fragte den Sultan nach seiner Meinung zum französischen Protektorat, und der Sultan antwortete, dass er es für einen unterdrückenden Kolonialismus halte und dass es sein Ziel sei, sein Land zu befreien, und dass es eine wachsende Unabhängigkeitsbewegung im Land gebe. Er würde sich jedoch an sein Versprechen halten, die Franzosen zu unterstützen, bis der Krieg gewonnen war. Roosevelt antwortete, er habe Vertrauen in die unabhängige Zukunft des Landes, die der Sultan als amerikanische Unterstützungserklärung für ein unabhängiges Marokko ansah, und dies gab der Unabhängigkeitsbewegung einen großen Impuls.
General Noguès, der von dem Treffen hörte, war besorgt und versuchte, den Sultan zu isolieren, indem er seinen engen Anhänger El Ayadi, der einer der mächtigsten feudalen Oberherren Marokkos war, mit dem anderen mächtigen Oberherrn T’hami el Glaoui verbündete, der ein überzeugter Anhänger der Franzosen war. Dies erwies sich als schwierig, da El Ayadi und T’hami El Glaoui nicht miteinander sprachen. Schließlich arrangierten die Franzosen eine Ehe zwischen den beiden Familien. Zu diesem Zeitpunkt war General Noguès bereits von der französischen Regierung von seinem Posten entfernt worden. Obwohl sie sich in ihren Zielen widersetzten, hatten General Noguès und der Sultan eine enge persönliche Freundschaft geschlossen, und beide weinten, als er den Sultan zum letzten Mal besuchte.
1944 kam es unter Gabriel Puaux, dem Nachfolger von General Noguès, zu Unruhen, Verhaftungen von Führern der Unabhängigkeitsbewegung und repressiven Maßnahmen der Franzosen. Nach dem Krieg würde es Aufstände und Repressionen geben, T’hami El Glaoui würde zweimal mit seinen Streitkräften aus seinen Atlas-Hochburgen absteigen, um Casablanca zu bedrohen, und Mohammed V. würde gezwungen sein, ins Exil zu gehen. Aber die Franzosen erkannten, dass sie Marokko nicht gegen die lokalen und internationalen Gefühle halten konnten, und 1956 wurde das Land unabhängig, und T’hami El Glaoui unterwarf sich seinem Erzfeind, dem Sultan, der bald darauf an Krebs starb.