Marokkó francia protektorátus volt, és a Vichy-kormány irányította, bár Marokkó szultánja volt a hivatalos uralkodó. Nem nagyon vettek részt a háborúban, a franciák meglehetősen soványak voltak a földön, Algéria volt a fő birtokuk Észak-Afrikában, míg a marokkóiaknak alig volt részük a háborúban, és nehezteltek a francia protektorátusra.
1941 augusztusában a francia Vichy-kormány olyan törvényeket hozott, amelyek diszkriminálták a marokkói zsidókat. Kvótákat állapított meg a zsidó orvosok és ügyvédek számára, kitaszította a diákokat a francia iskolákból, és sok európai negyedben élő zsidót arra kényszerített, hogy a mellahsba (hagyományos zsidó negyedbe) költözzenek.
a marokkói szultán, V. Mohammed azt mondta a zsidó vezetőknek, hogy véleménye szerint a zsidókat különválasztó Vichy törvények ellentmondanak a marokkói törvényeknek. Úgy vélte, hogy a zsidókat egyenlő bánásmódban kell részesíteni a muszlimokkal. Hangsúlyozta, hogy a zsidók tulajdona és élete az ő védelme alatt áll. Erős álláspontja miatt a Vichy adminisztrátorai nem hajtották végre energikusan a diszkriminatív törvényeket és rendeleteket.
amikor a szövetségesek 1942-ben partra szálltak, a Vichy-kormány három nap után megadta magát. Az 1943. januári Casablancai konferencián Roosevelt elnök, Winston Churchill, de Gaulle tábornok, Nogu Evolution tábornok (a marokkói francia csapatok Vichy parancsnoka és a protektorátus rezidens tábornoka) találkozott V. Mohammed szultánnal és fiával, Moulay Hassannal. A szultán jó benyomást tett Rooseveltre, és hat hónappal később Roosevelt, Churchill és a szultán megbeszélést tartottak francia jelenlét nélkül. Roosevelt megkérdezte a szultán véleményét a francia Protektorátusról, és a szultán azt válaszolta, hogy elnyomó gyarmatosításnak tartja, és hogy célja az ország felszabadítása, és hogy egyre növekvő függetlenségi mozgalom van az országban. A háború megnyeréséig azonban betartja ígéretét, hogy támogatja a franciákat. Roosevelt azt válaszolta, hogy bízik az ország független jövőjében, amelyet a szultán a független Marokkó támogatásának Amerikai nyilatkozatának tekintett, és ez nagy lendületet adott a függetlenségi mozgalomnak.
Nogu tábornok, aki hallott a találkozóról, aggódott, és megpróbálta elszigetelni a szultánt azzal, hogy szoros támogatóját, el Ayadit, aki Marokkó egyik legerősebb feudális hűbérurának számított, a másik hatalmas hűbérurral, T ‘ Hami el Glaouival, aki rendíthetetlen támogatója volt a franciáknak. Ez nehéznek bizonyult, mivel El Ayadi és T ‘ Hami El Glaoui nem voltak beszélő viszonyban. Végül a franciák házasságot kötöttek a két család között. Ekkorra Nogu generálist a francia kormány már eltávolította posztjáról. Bár céljaikat ellenezték, Nogu tábornok és a szultán szoros személyes barátságot kötött, és mindketten sírtak, amikor utoljára meglátogatta a szultánt.
1944-ben Gabriel Puaux, Nogu tábornok utódja alatt zavargások, a függetlenségi mozgalom vezetőinek letartóztatása és a franciák elnyomó intézkedései voltak. A háború után felkelések és elnyomások következtek, T ‘ Hami El Glaoui kétszer ereszkedett le Atlasz erődjeiből, hogy megfenyegesse Casablancát, V. Mohammed pedig száműzetésbe kényszerült. De a franciák felismerték, hogy a helyi és nemzetközi érzelmekkel szemben nem tudják megtartani Marokkót, és 1956-ban az ország függetlenné vált, és T ‘ Hami El Glaoui alávetette magát főellenségének, a szultánnak, aki nem sokkal később rákban halt meg.