彼の初期の年齢では、Brongniartは爬虫類の研究に焦点を当て、1800年にEssai dune classification naturally des reptilesを出版しました。 四つの分類はChelonia,Sauria,OphidiaおよびBatrachiaであった。 しかし、彼はBatrachiaを爬虫類のサブクラスとして分類しましたが、BrongniartはBatrachiaの解剖学的構造に他のクラスと比較して大きな違いがあることに気付きました。 この問題は1804年にピエール-ラトレイユによってバトラキアを両生類と呼ばれるクラスに置き換えて解決され、爬虫類のグループの残りの部分は保持された。 したがって、Batrachiansは、彼らが両生類であるように、もはや爬虫類として認識されていない唯一のグループです。
ブロンニャールにとって最も重要な仕事は、1811年にジョルジュ-キュヴィエと共同でパリ周辺の地質学の研究を行ったEssai sur la géographie minéralogique des environs de Parisであった。 当時、キュヴィエは、化石が由来する期間を把握し、それらが由来する期間に基づいて絶滅した哺乳類を再構築しようとしていました。 彼らの論文”Essai sur la géographie minéralogique des environs de Paris”は、非常に長い期間にわたって形成された9つの地層を特定しました。 最も古い地層から始まる地層は、チョーク、Argile Plastique、Calcaire grossier、Calcaire silicieux、Formation gypseuse、Sabels et Gres marins、Gres sans coquilliers、Terrain d’eau douce、Limon d’aterrissementと呼ばれていました。 Brongniartは、地層のいくつかは海洋軟体動物の化石を持っていたことを発見し、いくつかは淡水軟体動物の化石を持っていた。 彼は、これらの海洋層と淡水層の交互作用を使用して、地層が縮小する海洋によって堆積されたという理論を反証した。 この論文は1808年4月に最初に一般に読まれたが、1808年6月に延長され、その後1811年に延長された。 彼らは、岩石の特性に頼るのではなく、その化石の内容によって地球を研究した最初の人々の間でした。 共同作業の間に、彼らはまた、アブラハム*ヴェルナーの海王星主義に対する証拠を発見しました。 その結果、キュヴィエはカタストロフィズムを創造するようになった。
層序学におけるもう一つの重要な貢献は、彼がパリで調べた地層の化石含有量を使用して、深さや岩石学の代わりに他の場所の地層を特定するこ
1822年、ブロンニャルトはヨーロッパと北米の品種を分類し、年齢に基づいてそれらをグループ化しようとした三葉虫の最初の完全な研究を発表した。 この研究は、後の古生代層序の研究に貢献した。