înainte de” Rebeliunea Virginiei ” (așa cum a ajuns să fie numită) a început cu seriozitate în 1674, unii proprietari liberi de la frontiera Virginiei au cerut ca nativii americani, inclusiv cei din triburile prietenoase care trăiesc pe terenuri protejate de tratate, să fie alungați sau uciși. Dezgustul combinat pentru populația indiană din Virginia este un catalizator foarte discutat al rebeliunii lui Bacon, deoarece rebeliunea a fost în egală măsură despre „indieni violenți” și „acea ură”, așa cum era despre politica de frontieră Britanică. De asemenea, au protestat împotriva corupției în guvernul guvernatorului Berkeley, care a fost descris ca „incorigibil corupt, inuman opresiv și inexcusabil ineficient, mai ales în război”.
înainte de rebeliunea lui Bacon, războaiele Anglo-Powhatan au instituit separarea ierarhică distinctă și egoismul dintre indieni și Virginieni, care în cele din urmă s-ar forma în baza supunerii indienilor în timpul rebeliunii lui Bacon. În urma unui raid al indienilor Doeg din județul Stafford, Virginia, în care au fost uciși doi bărbați albi asociați cu un comerciant pe nume Mathews (despre care rapoartele ulterioare au găsit în mod regulat indieni „înșelați și abuzați”), un grup de milițieni din Virginia au atacat așezările din Susquehannock trib, în loc de tribul Doeg, inclusiv unii peste râul Potomac în Maryland. Guvernatorul din Maryland Calvert a protestat împotriva incursiunii, iar Susquehannocks au ripostat. Miliția din Maryland s-a alăturat apoi forțelor din Virginia și a atacat un sat fortificat Susquehannock. După ce cinci șefi au acceptat invitația liderului din Maryland la negocieri, au fost măcelăriți, acțiune care a provocat investigații legislative ulterioare și mustrări. Susquehannocks au ripostat în forță împotriva plantațiilor, ucigând 60 de coloniști în Maryland și alți 36 în primul lor asalt asupra solului din Virginia. Apoi s-au alăturat alte triburi, ucigând coloniști, arzând case și câmpuri și sacrificând animale până la râurile James și York.
căutând să evite un conflict mai mare similar cu Războiul regelui Filip din Noua Anglie, Berkeley a susținut izolarea, propunând construirea mai multor fortificații defensive de-a lungul frontierei și îndemnând coloniștii de frontieră să se adune într-o poziție defensivă. Coloniștii de frontieră au respins planul ca fiind scump și inadecvat și, de asemenea, au suspectat că ar putea fi un pretext pentru creșterea ratelor de impozitare.
între timp, Bacon, al cărui supraveghetor pe o plantație James River fusese ucis de atacatori indieni, a apărut ca un lider rebel. Când Berkeley a refuzat să-i acorde lui Bacon o comisie militară pentru a ataca toți indienii, Bacon și-a adunat propria forță de 400-500 de oameni și s-a mutat pe râul James pentru a ataca triburile Doeg și Pamunkey. Deși ambii trăiau în general în pace cu coloniștii și nu atacaseră așezările de frontieră, terenurile lor cultivate erau valoroase.
în martie, Berkeley a încercat să asigure războinicii din tribul Pamunkey pentru a lupta împotriva triburilor ostile în conformitate cu tratatele anterioare. Regina Pamunkey Cockacoeske a reamintit cu pasiune Consiliului guvernatorului despre moartea în urmă cu 20 de ani a soțului ei și a 100 de războinici pe care i-au furnizat într-o situație similară. Președintele a ignorat plângerea ei și, în schimb, a continuat să ceară mai mulți războinici, primind o promisiune în schimb de a furniza o duzină. Berkeley l-a arestat pe Bacon și l-a îndepărtat din consiliu, dar oamenii lui Bacon i-au asigurat rapid eliberarea și l-au forțat pe Berkeley să organizeze alegeri legislative. Între timp, oamenii lui Bacon și-au continuat ofensiva împotriva Pamunkeys, care au fugit în mlaștina Dragonului. Când amicalul Occoneechee a reușit să captureze un fort Susquehannock, forțele lui Bacon au cerut toate prada, deși nu au asistat la lupte. Apoi au atacat Oconeechee prin trădare, ucigând bărbați, femei și copii.
în ciuda statutului de haiduc al lui Bacon, alegătorii din județul Henrico l-au ales în casa de Burgesses recompusă. Acest organism a adoptat o serie de reforme radicale, limitând puterile guvernatorului și restabilind drepturile de vot pentru oamenii liberi fără pământ. De asemenea, au făcut ca vânzarea de arme oricărui Indian să fie pedepsită cu pedeapsa cu moartea. Adepții lui Bacon au fost nemolificați, acuzându-l pe Berkeley că a refuzat să autorizeze represalii împotriva nativilor pentru a-și proteja propriile investiții în comerțul cu blănuri și monopolurile pe care le acordase favoritelor sale. După o serie de altercații verbale, inclusiv o ceartă pe o stradă Jamestown, Berkeley s-a retras la plantația sa și a semnat Comisia Militară cerută de Bacon. În consecință, partidele de cercetare și-au propus rechiziționarea proviziilor, precum și uciderea și înrobirea indienilor, determinând proteste din partea cetățenilor din județul Gloucester care erau supuși exactităților miliției. Forțele lui Bacon s-au retras în plantația de mijloc (redenumită ulterior Williamsburg).
la 30 iulie 1676, Bacon și armata sa improvizată au emis o declarație a poporului, care critica administrația lui Berkeley, acuzându-l că a perceput impozite nedrepte, a numit prieteni în funcții înalte și nu a reușit să protejeze fermierii periferici de atacul Indian. De asemenea, au emis un „manifest”prin care îndemnau la exterminarea tuturor indienilor, afirmând că nu meritau Protecții legale, deoarece” au bin pentru acești mulți ani dușmani ai regelui și țării, tâlhari și hoți și invadatori ai dreptului Majestății Sale și a interesului și proprietății noastre”. Au urmat luni de conflict, inclusiv o încercare navală peste Potomac și în Golful Chesapeake de către aliații lui Bacon pentru a captura Berkeley la Accomac. Bacon însuși sa concentrat pe Pamunkey în Dragon Swamp; forțele sale au confiscat 3 încărcături de cai, au înrobit 45 de indieni și au ucis mulți alții, determinând Regina Cockacoeske (care a scăpat îngust cu fiul ei) să se arunce la mila Consiliului guvernatorului. Berkeley și-a ridicat propria armată de mercenari pe malul estic și, de asemenea, a capturat aliații navali ai lui Bacon și i-a executat pe cei doi lideri. Forțele lui Bacon s-au întors apoi împotriva capitalei coloniei, arzând Jamestown la pământ la 19 septembrie 1676.
înainte de sosirea unei escadrile navale engleze, Bacon a murit de dizenterie la 26 octombrie 1676. Deși John Ingram a preluat controlul asupra forțelor rebele, Rebeliunea s-a prăbușit în curând. Guvernatorul Berkeley a revenit la putere, confiscând proprietatea mai multor rebeli și spânzurând în cele din urmă douăzeci și trei de bărbați, mulți fără proces. După ce un comitet de anchetă și-a returnat raportul regelui Carol al II-lea, criticând atât Berkeley, cât și Bacon pentru comportamentul lor față de triburile prietenoase, Berkeley a fost eliberat de guvernare, s-a întors în Anglia pentru a protesta și a murit la scurt timp după aceea. Mai târziu, Carol al II-lea a comentat: „acel bătrân prost a ucis mai mulți oameni în acea țară goală decât am făcut-o aici pentru uciderea tatălui meu.”Acesta poate fi un mit colonial, apărut aproximativ 30 de ani mai târziu.