Czerwony Kryptonit to odmiana kryptonitu. Ma on różny wpływ na Kryptończyków. W The Silver Age comics i Lois & Clark: The New Adventures of Superman, każdy z nich ma inny wpływ na Kryptończyka; w Smallville usuwa ich zahamowania.
sztucznie wykonany Czerwony Kryptonit został stworzony przez Batmana przy użyciu zielonego kryptonitu i eksperymentów radiacyjnych przed JLA Tower of Babel story arc jako środek do unieszkodliwienia Supermana, jeśli kiedykolwiek stał się łotrem, ale został skradziony przez Ra ’ s al Ghula dla bardziej zabójczego użycia. Ekspozycja na sztuczny Czerwony Kryptonit sprawiła, że skóra Supermana stała się przezroczysta i sprawiła, że odczuwał intensywny ból, a także przeciążał jego naturalną absorpcję słoneczną do tego stopnia, że jego super zmysły zostały przytłoczone.
kolejny sztucznie wykonany Czerwony Kryptonit został stworzony przez Mr. Mxyzptlk i podarowany Lexowi Luthorowi w prezencie. Ten kawałek czerwonego kryptonitu działał podobnie do Złotego kryptonitu, w tym, że pozbawił Supermana wszystkich jego mocy. Jedynym sposobem na odwrócenie tego procesu była zasada wprowadzona przez MXY Dla Lexa: nie ujawniać, że to on stał za stworzeniem kryptonitu. Jeśli Lex ujawni, że mu się udało, jego wpływ na Supermana ustanie.