Maroko było francuskim protektoratem, rządzonym przez rząd Vichy, chociaż oficjalnym władcą był sułtan Maroka. Nie byli zbyt zaangażowani w wojnę, Francuzi byli raczej ciency na ziemi, a Algieria była ich główną własnością w Afryce Północnej, podczas gdy Marokańczycy mieli niewielki udział w wojnie i mieli pretensje do francuskiego protektoratu.
w sierpniu 1941 roku rząd Francji Vichy uchwalił ustawy dyskryminujące marokańskich Żydów. Ustalił on limity liczby żydowskich lekarzy i prawników, wyrzucił uczniów ze szkół francuskich i zmusił wielu Żydów mieszkających w europejskich dzielnicach do przeniesienia się do mellahs (tradycyjnych dzielnic żydowskich).
marokański Sułtan, Mohammed V, powiedział żydowskim przywódcom, że jego zdaniem ustawy Vichy wyróżniające Żydów są niezgodne z prawem marokańskim. Uważał, że Żydzi powinni być traktowani na równi z muzułmanami. Podkreślił, że majątek i życie Żydów pozostają pod jego opieką. Ze względu na jego zdecydowane stanowisko administratorzy Vichy nie wdrażali energicznie dyskryminujących przepisów i regulacji.
kiedy alianci wylądowali w 1942 roku, rząd Vichy skapitulował po trzech dniach. Na konferencji w Casablance w styczniu 1943 r. prezydent Roosevelt, Winston Churchill, generał de Gaulle, generał Noguès (dowódca wojsk francuskich w Maroku, rezydent Generalny protektoratu) spotkali się z sułtanem Mohammedem V i jego synem Moulayem Hassanem. Sułtan zrobił dobre wrażenie na Roosevelcie, a sześć miesięcy później Roosevelt, Churchill i Sułtan mieli spotkanie bez obecności Francuzów. Roosevelt poprosił sułtana o opinię na temat francuskiego protektoratu, a sułtan odpowiedział, że uważa go za opresyjny kolonializm i że jego celem jest wyzwolenie kraju, a w kraju rozwija się ruch niepodległościowy. Jednak dotrzymał przyrzeczenia wspierania Francuzów do czasu wygrania wojny. Roosevelt odpowiedział, że ma zaufanie do niezależnej przyszłości kraju, co Sułtan postrzegał jako amerykańską deklarację poparcia dla niepodległego Maroka i dało ruchowi niepodległościowemu wielki impuls.
generał Noguès, który usłyszał o spotkaniu, był zaniepokojony i próbował odizolować sułtana, łącząc jego bliskiego zwolennika El Ayadiego, który był jednym z najpotężniejszych władców feudalnych Maroka, z drugim potężnym władcą, t ’ Hami el Glaoui, który był zagorzałym zwolennikiem Francuzów. Okazało się to trudne, ponieważ El Ayadi i T ’ Hami El Glaoui nie rozmawiali ze sobą. Ostatecznie Francuzi zaaranżowali małżeństwo między obiema rodzinami. W tym czasie generał Noguès został już usunięty ze stanowiska przez rząd francuski. Mimo że byli przeciwni swoim celom, generał Noguès i Sułtan nawiązali bliską osobistą przyjaźń i obaj płakali, gdy po raz ostatni odwiedzali sułtana.
w 1944 r.za rządów Gabriela Puaux, następcy generała Noguèsa, miały miejsce zamieszki, aresztowania przywódców ruchu niepodległościowego i represje ze strony Francuzów. Po wojnie wybuchały powstania i represje, T ’ Hami El Glaoui dwukrotnie opuszczał twierdze Atlasu ze swoimi siłami, by zagrozić Casablance, a Mohammed V zmuszony był udać się na wygnanie. Ale Francuzi uznali, że nie mogą utrzymać Maroka przeciwko lokalnym i międzynarodowym nastrojom i w 1956 r.kraj stał się niezależny, A T ’ Hami El Glaoui poddał się swojemu arcyksięciu sułtanowi, umierając wkrótce na raka.