au existat îngrijorări din ce în ce mai mari cu privire la condițiile de sănătate și accesul la serviciile de sănătate, deoarece numărul refugiaților din Sudanul de Sud care intră în Uganda continuă să crească, în special în tabăra de refugiați Bidi Bidi, Reuters raportând că 180 de refugiați (aproape jumătate dintre ei copii mici) au murit în așezarea refugiaților Bidibidi în primele șase luni ale anului 2017. Acest lucru este agravat de modul în care există adesea o precizie limitată a măsurătorilor de sănătate în setările Taberei, sub-raportarea deceselor de către organizațiile umanitare apărând de obicei mai frecvent decât supra-raportarea deceselor.
din perspectiva drepturilor omului și a eticii, există, de asemenea, întrebări cu privire la faptul dacă persoanele cu abilități fizice diferite sau persoanele în vârstă nu sunt prioritizate în aceste așezări, primind mai puține resurse în comparație cu rezidenții mai tineri, capabili, în stare bună de sănătate. În așezările situate în districtul Ayilo din nordul Ugandei, de exemplu, Organizația Caritas raportează că programele au fost concepute pentru a oferi mai multă asistență pentru construirea latrinelor grupurilor identificate ca vulnerabile, cum ar fi rezidenții mai în vârstă, rezidenții cu dizabilități și gospodăriile cu cap de copil.
mai mult, un 2016 S. U. A. Raportul Departamentului de stat privind traficul avertizează că copiii din Sudanul de Sud din așezările de refugiați din nordul Ugandei ar putea fi vulnerabili la trafic, UNHCR suspectând că există deja cazuri de trafic în rândul tinerilor refugiați din Sudanul de Sud. Din păcate, cuantificarea fiabilă a numărului de copii traficați poate fi o provocare din cauza lipsei unei monitorizări eficiente, a corupției, a protecției insuficiente a victimelor, a diferențelor în definițiile termenilor și a altor aspecte contextuale.