Punainen kryptoniitti on Kryptoniittilaji. Sillä on erilaisia vaikutuksia Kryptonilaisiin. ”Silver Age” – sarjakuvissa ja ”Lois & Clark: The New Adventures of Superman” – sarjakuvissa jokaisella kryptonilaiselle altistumisella on erilainen vaikutus; Smallvillessä se poistaa heidän estonsa.
Batman loi keinotekoisesti valmistetun punaisen kryptoniitin käyttämällä vihreää kryptoniittia ja säteilykokeita ennen Baabelin tarinakaaren JLA-tornia keinona lamauttaa Teräsmies, jos tämä joskus lähtisi omille teilleen, mutta Ra ’ s al Ghul varasti sen tappavampaan käyttöön. Altistuminen keinotekoiselle Punaiselle Kryptoniitille sai Teräsmiehen ihon läpinäkyväksi ja aiheutti hänelle voimakasta kipua sekä ylikuormittamaan hänen luonnollisen auringon absorptionsa niin, että hänen superaistinsa hukkuivat.
Mr. Mxyzptlk ja annettiin Lex Luthorille lahjaksi. Tämä punaisen kryptoniitin kimpale toimi samalla tavalla kuin kultainen kryptoniitti, sillä se riisti Teräsmieheltä kaikki hänen voimansa. Ainoa tapa kumota prosessi oli MXY: n Lexille asettama sääntö: ei paljasteta, että hän oli kryptoniitin luomisen takana. Jos Lex paljastaisi tehneensä sen, sen vaikutukset Teräsmieheen lakkaisivat.