Il Marocco era un protettorato francese, e governato dal governo di Vichy, anche se il sultano del Marocco era il sovrano ufficiale. Non erano molto coinvolti nella guerra, i francesi erano piuttosto magri sul terreno, e l’Algeria era il loro principale possesso in Nord Africa, mentre i marocchini avevano poca partecipazione alla guerra e risentivano del protettorato francese.
Nell’agosto del 1941, il governo francese di Vichy emanò leggi che discriminavano gli ebrei marocchini. Stabilì quote sul numero di medici e avvocati ebrei, espulse gli studenti dalle scuole francesi e costrinse molti ebrei che vivevano nei quartieri europei a trasferirsi nei mellah (quartieri ebraici tradizionali).
Il sultano marocchino, Mohammed V, disse ai leader ebrei che a suo parere le leggi di Vichy che individuavano gli ebrei erano incoerenti con la legge marocchina. Credeva che gli ebrei dovessero essere trattati allo stesso modo con i musulmani. Ha sottolineato che la proprietà e la vita degli ebrei sono rimasti sotto la sua protezione. A causa della sua forte posizione, gli amministratori di Vichy non hanno attuato energicamente le leggi e i regolamenti discriminatori.
Quando gli alleati sbarcarono nel 1942, il governo di Vichy si arrese dopo tre giorni. Alla conferenza di Casablanca del gennaio 1943, il presidente Roosevelt, Winston Churchill, il generale de Gaulle, il generale Noguès (Vichy comandante delle truppe francesi in Marocco e residente generale del protettorato) incontrarono il sultano Mohammed V e suo figlio Moulay Hassan. Il sultano fece una buona impressione su Roosevelt, e sei mesi dopo Roosevelt, Churchill e il Sultano ebbero un incontro senza alcuna presenza francese. Roosevelt chiese al sultano la sua opinione sul protettorato francese, e il sultano rispose che lo considerava colonialismo oppressivo, e che il suo obiettivo era quello di liberare il suo paese, e che c’era un crescente movimento indipendentista nel paese. Tuttavia, avrebbe rispettato il suo impegno a sostenere i francesi fino alla vittoria della guerra. Roosevelt rispose che aveva fiducia nel futuro indipendente del paese, che il sultano vedeva come una dichiarazione americana di sostegno per un Marocco indipendente, e diede al movimento indipendentista un grande impulso.
Il generale Noguès, venuto a conoscenza dell’incontro, era preoccupato e cercò di isolare il sultano alleandosi con il suo stretto sostenitore El Ayadi, che era uno dei più potenti signori feudali del Marocco, con l’altro potente signore, T’hami el Glaoui, che era un convinto sostenitore dei francesi. Ciò si rivelò difficile, poiché El Ayadi e T’hami El Glaoui non parlavano. Alla fine, i francesi organizzarono un matrimonio tra le due famiglie. A quel tempo, il generale Noguès era già stato rimosso dal suo incarico dal governo francese. Anche se erano contrari nei loro obiettivi, il generale Noguès e il Sultano avevano formato una stretta amicizia personale, ed entrambi piangevano quando venne a visitare il Sultano per l’ultima volta.
Nel 1944, sotto Gabriel Puaux, successore del generale Noguès, ci sarebbero state rivolte, arresti di leader del movimento indipendentista e misure repressive da parte dei francesi. Dopo la guerra, ci sarebbero state rivolte e repressioni, T’hami El Glaoui sarebbe sceso due volte dalle sue roccaforti dell’Atlante con le sue forze per minacciare Casablanca, e Mohammed V sarebbe stato costretto ad andare in esilio. Ma i francesi riconobbero che non potevano resistere al Marocco contro i sentimenti locali e internazionali, e nel 1956 il paese divenne indipendente, e T’hami El Glaoui si sottomise al suo acerrimo nemico il Sultano, morendo di cancro poco dopo.