1674年に”バージニアの反乱”が本格的に始まる前に、バージニアフロンティアの自由所有者の中には、条約で保護された土地に住んでいる友好的な部族を含むネイティブアメリカンを追い出すか殺されるべきであることを要求した。 バージニア州のインディアン人口に対する嫌悪感は、ベーコンの反乱の非常に議論されていない触媒であり、反乱はイギリスのフロンティア政策と同様に”激しくインディアン”と”その憎しみ”についても同様であった。 彼らはまた、バークレー州知事の政府の腐敗に対して抗議したが、これは「間違いなく腐敗しており、非人道的に抑圧的であり、特に戦争においては許せないほど非効率的である」と説明されている。
ベーコンの反乱に先立って、アングロ・ポウハタン戦争は、インディアンとバージニア人の間に明確な階層的分離と利己主義を制定し、最終的にベーコンの反乱の間にインディアンを征服するための基礎になるであろう。 バージニア州スタッフォード郡でドッグ族インディアンが襲撃を受け、マシューズという交易業者と関係のある2人の白人が殺された後、バージニア民兵隊の一団がドッグ族の代わりにサスケハノック族の集落を襲撃した。 メリーランド州知事カルバートはこの侵略に抗議し、サスケハノック族は報復した。 メリーランド民兵隊はバージニア軍と合流し、要塞化されたサスケハノック村を攻撃した。 5人の酋長がメリーランド州の指導者のパーリーへの招待を受け入れた後、彼らは虐殺され、後の立法調査と叱責を引き起こした。 サスケハノック族はプランテーションに対する報復を行い、メリーランド州の開拓者60人とバージニア州の土地への最初の攻撃でさらに36人を殺した。 その後、他の部族が加わり、開拓者を殺し、家や畑を燃やし、ジェームズ川とヨーク川まで家畜を屠殺した。
ニューイングランドにおけるフィリップ王戦争と同様の大きな紛争を回避しようと、バークレーは封じ込めを提唱し、フロンティアに沿っていくつかの防御要塞の建設を提案し、フロンティア開拓者に防御的な姿勢で集まるよう促した。 フロンティア開拓者はこの計画を高価で不十分であると却下し、またそれが税率を上げるための口実かもしれないと疑った。
一方、ジェームズ川のプランテーションの監督者がインディアンの襲撃者によって殺されたベーコンは、反乱軍の指導者として浮上した。 バークレーが全てのインディアンを攻撃する軍事委員会をベーコンに与えることを拒否したとき、ベーコンは400から500名の軍隊を召集し、ジェームズ川を遡ってドッグ族とパムンキー族を攻撃した。 両者は一般的に入植者と平和的に暮らしており、フロンティア開拓地を攻撃していなかったが、彼らの耕作地は貴重であった。
3月、バークレーは以前の条約に従って敵対的な部族と戦うためにパムンキー族から戦士を確保しようとしていた。 パムンキーの女王コッカコースケは、20年前に彼女の夫と100人の戦士が同様の状況で提供したことを知事の評議会に情熱的に思い出させました。 会長は彼女の苦情を無視し、代わりにダースを供給する見返りに約束を受けて、より多くの戦士を要求し続けていました。 バークレーはベーコンを逮捕し、評議会から彼を取り除いたが、ベーコンの部下はすぐに彼の解放を確保し、バークレーに立法選挙を開催させた。 一方、ベーコンの部隊はドラゴン沼に逃げ込んだパムンキー族に対する攻撃を続けた。 友好的なオコーニーチーがサスケハノック砦を占領することができたとき、ベーコンの部隊は戦闘を支援していなかったが、すべての戦利品を要求した。 彼らはその後、裏切りによってオコニーチー族を攻撃し、男性、女性、子供を殺した。
ベーコンの無法者の地位にもかかわらず、ヘンリコ郡の有権者は彼を再構成されたバージェス下院議員に選出した。 その機関は、知事の権限を制限し、土地のない自由人への参政権を回復し、抜本的な改革の数を制定しました。 彼らはまた、死刑によって罰せられる任意のインド人への任意の武器の販売を行いました。 ベーコンの支持者たちは、バークレーが自分の毛皮取引への投資と自分のお気に入りに与えた独占を保護するために原住民に対する報復を承認することを拒否したと非難して、無認可にされた。 ジェームズタウン通りで口論を含む多くの口頭での口論の後、バークレーは自分のプランテーションに撤退し、ベーコンが要求した軍事委員会に署名した。 それに応じて偵察隊は物資を徴用し、インディアンを殺し奴隷にし、グロスター郡の市民から民兵隊の要求を受けた抗議を促した。 ベーコン軍はミドルプランテーション（後にウィリアムズバーグと改名）に退却した。
1676年7月30日、ベーコンとそのその場しのぎの軍隊は国民宣言を発し、バークレーの政権を批判し、不公平な税金を徴収し、友人を高い地位に任命し、インディアンの攻撃から辺境の農民を守ることに失敗したと非難した。 彼らはまた、すべてのインディアンの絶滅を促す”マニフェスト”を発行し、”王と国、強盗と泥棒、そして陛下の権利と私たちの利益と財産の侵略者に対するこれらの長年の敵を持っている”ため、彼らは法的保護に値しないと主張した。 ポトマック湾とチェサピーク湾でベーコンの同盟国がアコマックでバークレーを占領しようとしたことを含む数ヶ月の紛争が続いた。 ベーコン自身はドラゴン沼のPamunkeyに焦点を当てました; 彼の軍は馬で3つの物資を押収し、45人のインディアンを奴隷にし、さらに多くを殺し、女王コッカコースケ（息子と一緒に狭く逃げた）に知事の評議会の慈悲に身を投げるよう促した。 バークレーは東岸で自らの傭兵軍を育て、ベーコンの海軍の同盟国を捕らえて2人の指導者を処刑した。 その後、ベーコンの部隊は植民地の首都に向かい、1676年9月19日にジェームズタウンを焼き払った。
イギリス海軍飛行隊が到着する前に、ベーコンは1676年10月26日に赤痢で死亡した。 ジョン・イングラムが反乱軍の支配権を握ったが、反乱はすぐに崩壊した。 バークレー知事は権力を取り戻し、数人の反乱軍の財産を押収し、最終的には23人の男性を絞首刑にしたが、その多くは裁判なしであった。 調査委員会がチャールズ2世に報告書を返し、バークレーとベーコンの双方が友好的な部族に向かって行動したことを批判した後、バークレーは知事職を解任され、抗議のためにイングランドに戻り、その直後に死亡した。 チャールズ2世は後に、「あの古い愚か者は、私が父の殺害のためにここで行ったよりも、その裸の国でより多くの人々を死に至らせました。”これは約30年後に発生した植民地の神話かもしれません。