En la cruz número 94, en la desembocadura del río Nueces, Escandón describió un lugar rico en «semillas, pastizales, sal, peces, madera y piedra» que podría prosperar si la cercana Bahía de San Miguel Arcángel (Bahía Corpus Christi) fuera lo suficientemente profunda para el comercio marítimo. Sin embargo, temía que fuera la más difícil de asentar, dada la «gran distancia a la que se encuentra de las Provincias de Coahuila y del Nuevo Reino de León». Sugirió colonizar el asentamiento con «cincuenta familias de españoles a un costo de 200 pesos por cada uno y 500 por su capitán.»
La Cruz número 95 se refería a un lugar en el río San Antonio que el Capitán Joaquín de Orobio y Bazterra, del Presidio de Bahía, llamó «Santa Dorotea», cuando se detuvo allí en la fiesta de Santa Dorotea el 6 de febrero. Para Orobio y Bazterra, «todas las buenas cualidades que se requieren para un asentamiento convergen en el lugar de parada», incluidos los abundantes recursos naturales y el fácil acceso a la bahía. Escandón, por su parte, pensó que la difícil misión y presidio de Bahía del Espíritu Santo debía ser reubicada aquí, en Santa Dorotea, y aconsejó a la junta Real que lo hiciera. Debido al suelo rocoso y a un clima pobre, la misión tuvo dificultades para cultivar en su ubicación actual, explicó Escandón, y por lo tanto no había logrado atraer a muchos residentes indios de tiempo completo. Mover la misión la acercaría a dos asentamientos importantes de indios Cujanes y Carancaguazes (Karankawa), creando «una reunión decente una vez que se recolecta la primera cosecha de maíz, chiles y frijoles.»También reduciría el aislamiento del propuesto asentamiento Nueces en la cruz número 94.
Estas dos recomendaciones de Escandón resultarían en los cimientos de la efímera Villa de Vedoya (cerca del futuro sitio de Corpus Christi) y La Bahía (Goliad), respectivamente. Pero el mapa y el informe de Escandón tuvieron otras consecuencias importantes para la historia del sur de Texas. Funcionarios reales, después de estudiar ambos documentos, dieron a Escandón su bendición para llevar a cabo su plan de colonización como se describe, otorgándole el título de «Conde de la Sierra Gorda» y dotándole de un presupuesto de unos 115.000 pesos. Nombrado gobernador de la nueva provincia, Escandón se encargó de poblarla y establecer un sistema de gobierno.
Fase dos del esfuerzo de colonización-el reclutamiento de colonos y misioneros, la fundación de ciudades y misiones, la designación de líderes político-militares, etc. – comenzó en 1749; y fue en esta fase que Escandón se convirtió en el «Padre del sur de Texas».»
Escandón se aventuró de nuevo en el Seno Mexicano con una caravana masiva de soldados y colonos. Reactivando la red de colaboradores de su primera expedición, recurrió a Blas María de la Garza y Falcón, un militar bien conectado de Cerralvo, Nuevo León, para ayudar a crear nuevas comunidades en el Río Grande. Garza de la Falcón fundó Camargo (que incluía la actual Ciudad de Río Grande) en 1749, la estableció con familias Cerralvo, y estableció un gran rancho en el actual Condado Nueces poco después. Se habían sentado las bases de la legendaria cultura ganadera del sur de Texas.
El proyecto de asentamiento de Escandón fue tremendamente exitoso. En total, se fundaron 23 nuevos asentamientos bajo el liderazgo de Escandón durante los siguientes siete años, incluida una línea de pueblos a lo largo del Río Grande que más tarde se llamarían las «villas del norte» o pueblos del norte (Laredo, Revilla, Mier , Camargo y Reynosa).
La administración de Escandón de la nueva provincia pronto se convirtió en objeto de controversia, particularmente con los colonos de las villas del norte. Sin embargo, sus esfuerzos colonizadores habían dado forma a toda una región de la Nueva España y, de alguna manera, sentaron las bases para las amplias reformas inspiradas en la Ilustración a lo largo de las tierras fronterizas españolas en la década de 1760. Escandón rompió con los precedentes al excluir a los presidios del esquema y socavar la autoridad de los misioneros franciscanos. Su proyecto fue también uno de los primeros «proyectos de colonización» verdaderamente modernos en la Nueva España. Esto se debe a que no dependía principalmente de la conquista y reorganización de las sociedades indígenas, sino del trasplante a gran escala de colonos-españoles nacidos en Estados Unidos, mestizos y afro mestizos, e «indios cristianizados» — a áreas habitadas por relativamente pocos grupos nativos. Además, a diferencia de los asentamientos en otras partes de la actual Texas, los de Escandón eran completamente civiles-no estaban vinculados a misiones o presidios — y de esa manera, presagiaban las colonias de empresarios de las décadas de 1820 y 1830.
La exploración, cartografía y colonización del Seno Mexicano de Escandón proporcionó la base para que España fortaleciera su dominio en el territorio remoto que se convirtió en Texas. Sin la presencia en el actual sur de Texas de los asentamientos de Escandón, y el ejército español para defenderlos, el desarrollo de la zona probablemente habría sido muy diferente. Se podría argumentar que Escandón comenzó la locura por la colonización del norte que más tarde animaría a Stephen F. Austin y a muchos otros, lo que llevó a la formación del Texas que conocemos hoy en día.
