rosły obawy dotyczące warunków zdrowotnych i dostępu do usług zdrowotnych, ponieważ liczba uchodźców z Sudanu Południowego przybywających do Ugandy nadal rośnie, w szczególności BIDI BIDI refugee camp, z Reuters donosi, że 180 uchodźców (prawie połowa z nich małe dzieci) zmarło w Bidibidi Refugee Settlement w ciągu pierwszych sześciu miesięcy 2017 roku. Jest to spotęgowane tym, że często dokładność pomiarów stanu zdrowia w obozach jest ograniczona, a niedostateczne zgłaszanie zgonów przez organizacje humanitarne zwykle występuje częściej niż nadmierne zgłaszanie zgonów.
z punktu widzenia praw człowieka i etyki pojawiają się również pytania o to, czy osoby o różnych zdolnościach fizycznych lub osoby starsze nie są traktowane priorytetowo w tych osiedlach, otrzymując mniej zasobów w porównaniu z młodszymi, sprawnymi mieszkańcami w dobrym zdrowiu. Na przykład w osadach położonych w dystrykcie Ayilo w północnej Ugandzie Organizacja Caritas donosi, że programy zostały zaprojektowane w celu zapewnienia większej pomocy w budowaniu latryn grupom zidentyfikowanym jako wrażliwe, takim jak starsi mieszkańcy, niepełnosprawni mieszkańcy i gospodarstwa domowe z dziećmi.
Raport Departamentu Stanu w sprawie handlu ludźmi ostrzega, że dzieci z Sudanu Południowego w północnych ugandyjskich osiedlach uchodźców mogą być narażone na handel ludźmi, a UNHCR podejrzewa, że przypadki handlu ludźmi już występują wśród młodych uchodźców z Sudanu Południowego. Niestety rzetelne określenie liczby dzieci będących przedmiotem handlu może stanowić wyzwanie ze względu na brak skutecznego monitorowania, korupcję, niewystarczającą ochronę ofiar, różnice w definicjach pojęć i inne aspekty kontekstowe.