dlaczego Lizyna jest skracana do ' K '? [duplikat]

jako pierwsi opublikowali specyficzny system jednoliterowych skrótów, in on proteins. LXIII. niższe struktury w łańcuchach białek zebrać. Czech. Chem. Commun. 1961, 26, 531-578.

w tej publikacji ukazał się również wcześniej niepublikowany system Hansa Neuratha.

jeśli mają zostać zaproponowane symbole praktyczne, muszą one spełniać następujące wymagania: (l) należy wybrać 23 różne jednoliterowe symbole aminokwasów występujących w strukturach białkowych, (2) należy użyć tylko prostych symboli dostępnych obecnie w drukarniach z możliwością napisania za pomocą zwykłych maszyn do pisania, (3) symbole muszą oferować możliwość wyrażenia, czy Wiązanie sekwencji jest określone lub, alternatywnie, do tej pory nieokreślone, w przestrzeni jednej litery, oraz (4) użycie symboli musi mieć zastosowanie międzynarodowe.

użycie cyfr jest wykluczone przez wymóg (1), A użycie greckich lub innych nietypowych liter i symboli przez wymóg (2). Najodpowiedniejszym sposobem wydaje się być użycie wspólnych liter alfabetu łacińskiego, które spełniają wymóg (4) i pozwalają na rozróżnienie zgodnie z (3) między ustalonymi i nieokreślonymi sekwencjami, wybierając duże lub małe litery. Aby wyrazić określoną sekwencję łańcucha peptydowego, proponujemy użyć wielkich liter zgodnie z tabelą VIII, a następnie umieścić małe litery w miejscach, w których dotychczas stosowano nawiasy i przecinki. Nasze symbole pochodzą od angielskich nazw aminokwasów. Ponieważ jednak identyczne litery często powtarzają się na początku nazw, nie mogły być konsekwentnie stosowane w naszych symbolach. Nie można też opracować dokładnego systemu obejmującego dwuliterowe symbole dwóch pierwszych liter nazwy (np. kwas glutaminowy, Glutamina, glicyna); co więcej, byłoby to sprzeczne z zamierzonym systemem jednoliterowych symboli. Dlatego skompromitowaliśmy i pierwsze litery są proponowane jako symbole tylko w niektórych przypadkach (kwas asparaginowy, kwas glutaminowy, cystyna (pół -), histydyna, metionina, prolina, seryna, tryptofan, walina), w wielu innych przypadkach wybrano charakterystyczne symbole pochodzące z pisowni (ala – l, arg – r, lys – i, leu – u, ileu – w, phe – f) lub z reprezentacji graficznej (Glu – g, glu(NH$_2$) – q).

Šorm jako pierwszy zastosował „Q” Dla glutaminy. (Neurath stosował „E” zarówno dla glutaminy, jak i kwasu glutaminowego.)

Neurath użył „O” dla lizyny, a Šorm użył „I”.

do czasu wyboru przez IUPAC nie był używany żaden ujednolicony system.

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.

More: