hvorfor lysin forkortes som ' K '? [duplikat]

Kristorm et al. var de første til at offentliggøre et specifikt forkortelsessystem med et enkelt bogstav, ind på proteiner. Lavere strukturer i proteinkæderne samles. Tjekkisk. Chem. Commun. 1961, 26, 531-578.

i denne publikation blev et tidligere, tidligere upubliceret system af hans Neurath også offentliggjort.

hvis praktiske symboler skal foreslås, skal de overholde følgende krav: l) der skal vælges 23 forskellige symboler på aminosyrer med et bogstav, der forekommer i proteinstrukturer, 2) der skal kun anvendes enkle symboler, der i øjeblikket er tilgængelige i trykkerier, og som kan skrives af almindelige skrivemaskiner, 3) symbolerne skal give mulighed for at udtrykke, om sekvensens binding bestemmes eller alternativt hidtil ubestemt inden for et enkelt bogstav, og 4) brugen af symboler skal være af international anvendelse.

brugen af tal er udelukket ved krav (1), og brugen af græske eller andre usædvanlige bogstaver og symboler ved krav (2). Den mest hensigtsmæssige måde synes at være brugen af de almindelige bogstaver i det latinske alfabet, som er i overensstemmelse med krav (4) og tillader at skelne i henhold til (3) mellem bestemte og ubestemte sekvenser ved at vælge enten store eller små bogstaver. For at udtrykke en bestemt sekvens af peptidkæden foreslår vi at bruge store bogstaver i henhold til tabel VIII og endvidere at placere små bogstaver på steder, hvor parenteser og kommaer hidtil er blevet brugt. Vores symboler er afledt af de engelske navne på aminosyrer. Da imidlertid identiske bogstaver ofte gentager sig i begyndelsen af navnene, kunne de ikke konsekvent bruges i vores symboler. Der kunne heller ikke udarbejdes et grundigt system med symboler på to bogstaver på de to første bogstaver i navnet (f. eks. glutaminsyre, glutamin, glycin); desuden ville dette være i modstrid med det tilsigtede system med symboler med et bogstav. Derfor har vi kompromitteret, og de første bogstaver foreslås kun som symboler i nogle tilfælde (asparaginsyre, glutaminsyre, cystin (halv-), histidin, methionin, prolin, serin, tryptophan, valin), i mange andre tilfælde karakteristiske symboler afledt enten fra stavemåden (ala – l, arg – r, lys – i, leu – u, ileu – v, phe – f) eller fra den grafiske repræsentation (glu – g, glu(nh$_2$)- K) blev valgt.

han var den første til at bruge “K” til glutamin. (Neurath havde brugt “E’ til både glutamin og glutaminsyre.)

Neurath brugte “O” til lysin, og “I”blev brugt til “i”.

intet samlet system blev brugt før valg af IUPAC.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.

More: