problemer med Salk-vaccinen
accept af vaccinen var ikke uden problemer. Salk blev kritiseret, fordi der blev foretaget en skarp Holly-lignende forfremmelse for vaccinen. Også nogle medicinske kolleger favoriserede en levende virusvaccine. Den levende virusvaccine udviklet af Dr. Albert Sabin (1906-1993) indeholdt en mutant (ændret, anden) form af poliovirus, kaldet en avirulent virus. Det betyder, at det ikke var i stand til at skade kroppens forsvar. Den levende virusvaccine havde fordele i forhold til den dræbte virusvaccine. Det kunne indgives oralt (gennem munden) snarere end ved injektion, og en dosis gav permanent immunitet.
det største problem med Salk-vaccinen var, at forkert produktion af vaccinen af nogle medicinalfirmaer resulterede i, at vaccinen blev forurenet med levende poliovirus. Mange hundrede børn døde eller blev ekstremt syge på grund af dette.
Salk blev under sine polioundersøgelser forskerprofessor i bakteriologi ved Pittsburgh, Pennsylvania, (1949-1954) og professor i forebyggende medicin (1954-1957). I 1957 blev han udnævnt til professor i eksperimentel medicin.
i 1963 åbnede han Salk Institute for Biological Studies i San Diego, Californien. Der studerede han og hans kolleger problemer i forbindelse med kroppens autoimmuniseringsreaktion; det vil sige, hvorfor kroppen afviser fremmed materiale, for eksempel en organtransplantation.
Jonas Salk døde den 23.juni 1995 i La Jolla, Californien, i en alder af firs af hjertesvigt. I sin levetid var han i stand til at se virkningerne af sit livs arbejde. Da Salk døde, var polio næsten forsvundet fra USA.