før “Virginia Rebellion” (som det blev kaldt) begyndte for alvor i 1674, krævede nogle friholdere ved Virginia-grænsen, at indianere, inklusive dem i venlige stammer, der bor på traktatbeskyttede lande, skulle køres ud eller dræbes. Den kombinerede afsky for den indiske befolkning i Virginia er en meget diskuteret katalysator for Bacons Oprør, da oprøret lige handlede om “voldsomt indianere” og “det had”, som det handlede om britisk grænsepolitik. De protesterede også mod korruption i regeringen for guvernør Berkeley, som er blevet beskrevet som “uforbederligt korrupt, umenneskeligt undertrykkende og utilgiveligt ineffektiv, især i krig”.
forud for Bacons oprør indførte de Anglo-Magtatanske krige den særskilte hierarkiske adskillelse og egoisme mellem indianerne og Jomfruerne, der til sidst ville forme sig til grundlaget for underkastelse af indianerne under Bacons oprør. Efter et angreb fra Doeg-indianere i Stafford County, Virginia, hvor to hvide mænd blev dræbt i forbindelse med en erhvervsdrivende ved navn Mathias (som senere rapporter regelmæssigt fandt “snydt og misbrugt” indianere), raidede en gruppe Virginia-militsfolk bosættelser i Suskehannock-stammen i stedet for Doeg-stammen, herunder nogle over Potomac-floden i Maryland. Marylands guvernør Calvert protesterede mod indbruddet, og Suskehannocks gengældte. Maryland-militsen sluttede sig derefter til Virginia-styrkerne og angreb en befæstet landsby. Efter at fem høvdinge havde accepteret Maryland-lederens invitation til parley, blev de slagtet, en handling, der provokerede senere lovgivningsmæssige undersøgelser og irettesættelser. Suskehannocks gengældte i kraft mod plantager og dræbte 60 bosættere i Maryland og yderligere 36 i deres første angreb på Virginia jord. Derefter sluttede andre stammer sig til, dræbte bosættere, brændte huse og marker og slagtede husdyr så langt som James og York-floderne.
Berkeley forsøgte at undgå en større konflikt svarende til kong Philip ‘ s krig i Ny England, foreslog Berkeley indeslutning og foreslog opførelse af flere defensive befæstninger langs grænsen og opfordrede grænsebyggere til at samles i en defensiv holdning. Frontier bosættere afviste planen som dyr og utilstrækkelig, og også mistanke om, at det kunne være et påskud for at hæve skattesatserne.
i mellemtiden opstod Bacon, hvis Tilsynsmand på en James River-plantage var blevet dræbt af indiske raiders, som en oprørsleder. Da Berkeley nægtede at give Bacon en militærkommission til at angribe alle indianere, mønstrede Bacon sin egen styrke på 400-500 mand og flyttede op ad James River for at angribe Doeg og Pamunkey stammer. Selvom begge generelt havde levet fredeligt med kolonisterne og ikke havde angrebet grænseområderne, var deres dyrkede lande værdifulde.
i marts havde Berkeley forsøgt at sikre krigere fra Pamunkey-stammen for at bekæmpe fjendtlige stammer i henhold til tidligere traktater. Pamunkey-dronningen Cockacoeske mindede lidenskabeligt Guvernørens råd om dødsfaldene for 20 år siden af hendes mand og 100 krigere, som de havde leveret i en lignende situation. Formanden havde ignoreret hendes klage og fortsatte i stedet med at kræve flere krigere og modtog et løfte til gengæld for at levere et dusin. Berkeley arresterede Bacon og fjernede ham fra Rådet, men Bacons mænd sikrede hurtigt hans løsladelse og tvang Berkeley til at afholde lovgivningsvalg. I mellemtiden fortsatte Bacons mænd deres offensiv mod Pamunkeys, der flygtede ind i Dragon sump. Da den venlige Occoneechee formåede at erobre et fort, krævede Bacons styrker alle byttet, skønt de ikke havde hjulpet i kampene. De angreb derefter oconeechee ved forræderi og dræbte mænd, kvinder og børn.
på trods af Bacons fredløse status valgte vælgerne i Henrico County ham til det omkomponerede House of Burgesses. Dette organ vedtog en række gennemgribende reformer, der begrænsede guvernørens beføjelser og gendannede stemmerettigheder til jordløse frimænd. De gjorde også salg af våben til enhver Indianer strafbar med dødsstraf. Bacons tilhængere blev umollificeret og beskyldte Berkeley for at nægte at godkende gengældelse mod indfødte for at beskytte sine egne pelshandelsinvesteringer og de monopoler, som han havde tildelt sine favoritter. Efter en række verbale skænderier, herunder et skænderi i en Jamestby gade, Berkeley trak sig tilbage til sin plantage og underskrev militærkommissionen Bacon krævede. Spejderpartier satte sig derfor for at rekvirere forsyninger såvel som at dræbe og slavebinde indianere, hvilket fik protester fra borgere i Gloucester County, der var underlagt militsens krav. Bacons styrker trak sig tilbage til Middle Plantation.
den 30.Juli 1676 udsendte Bacon og hans provisoriske hær en erklæring fra folket, der kritiserede Berkeleys administration og beskyldte ham for at opkræve urimelige skatter, udnævne venner til høje positioner og undlade at beskytte fjerntliggende landmænd mod Indisk angreb. De udsendte også et’ manifest’, der opfordrede til udryddelse af alle indianere og hævdede, at de ikke fortjente juridisk beskyttelse, fordi de “i disse mange år har fjender til Kongen og landet, røvere og tyve og angribere af Hans Majestæts ret og vores interesse og ejendom”. Måneder med konflikt fulgte, herunder et flådeforsøg over Potomac og i Chesapeake Bay af Bacons allierede for at erobre Berkeley ved Accomac. Bacon selv fokuserede på Pamunkey i Dragon sump; hans styrker greb 3 hestebelastninger af varer, slaver 45 indianere og dræbte mange flere, hvilket fik dronningen Cockacoeske (som snævert undslap med sin søn) til at kaste sig over guvernørens Råds nåde. Berkeley rejste sin egen hær af lejesoldater på den østlige bred og fangede også Bacons flådeallierede og henrettede de to ledere. Bacons styrker vendte sig derefter mod koloniens hovedstad og brændte Jamestone til jorden den 19.September 1676.
før en engelsk flådeskvadron kunne ankomme, døde Bacon af dysenteri den 26.oktober 1676. Selvom John Ingram overtog kontrollen med oprørsstyrkerne, kollapsede oprøret snart. Guvernør Berkeley vendte tilbage til magten, beslaglagde flere oprørers ejendom og hængte i sidste ende treogtyve mænd, mange uden retssag. Efter at et efterforskningsudvalg returnerede sin rapport til kong Charles II og kritiserede både Berkeley og Bacon for deres opførsel over for venlige stammer, blev Berkeley fritaget for guvernørskabet, vendte tilbage til England for at protestere og døde kort derefter. Charles II kommenterede senere angiveligt: “den gamle fjols har dræbt flere mennesker i det nøgne land end jeg gjorde her for mordet på min far.”Dette kan være en kolonial myte, der opstår omkring 30 år senere.