Šorm et al. waren die ersten, die ein bestimmtes Abkürzungssystem mit einem Buchstaben veröffentlichten, in Über Proteine. LXIII. Niedrigere Strukturen in den Ketten von Proteinen sammeln sich. Tschechisch. Chem. Commun. 1961, 26, 531-578.
In dieser Veröffentlichung wurde auch ein früheres, bisher unveröffentlichtes System von Hans Neurath veröffentlicht.
Wenn praktische Symbole vorgeschlagen werden sollen, müssen sie den folgenden Anforderungen entsprechen: (1) Es müssen 23 verschiedene einbuchstabige Symbole von Aminosäuren gewählt werden, die in Proteinstrukturen vorkommen, (2) es müssen nur einfache Symbole verwendet werden, die derzeit in Druckereien mit der Möglichkeit zugänglich sind, mit üblichen Schreibmaschinen geschrieben zu werden, (3) die Symbole müssen die Möglichkeit bieten, auszudrücken, ob die Bindung der Sequenz innerhalb eines einzigen Buchstabens bestimmt oder alternativ bisher unbestimmt ist, und (4) die Verwendung von Symbolen muss international anwendbar sein.
Die Verwendung von Zahlen ist durch Vorschrift (1) und die Verwendung griechischer oder anderer ungewöhnlicher Buchstaben und Symbole durch Vorschrift (2) ausgeschlossen. Die geeignetste Art und Weise scheint die Verwendung der gemeinsamen Buchstaben des lateinischen Alphabets zu sein, die dem Erfordernis (4) entspricht und es erlaubt, gemäß (3) zwischen bestimmten und unbestimmten Sequenzen zu unterscheiden, indem entweder Groß- oder Kleinbuchstaben gewählt werden. Um eine bestimmte Sequenz der Peptidkette auszudrücken, schlagen wir vor, Großbuchstaben gemäß Tabelle VIII zu verwenden und ferner Kleinbuchstaben an Stellen zu setzen, an denen bisher Klammern und Kommas verwendet wurden. Unsere Symbole leiten sich von den englischen Namen der Aminosäuren ab. Da jedoch identische Buchstaben häufig am Anfang der Namen wiederkehren, konnten sie nicht konsequent in unseren Symbolen verwendet werden. Es konnte auch kein gründliches System mit zweibuchstabigen Symbolen der ersten beiden Buchstaben des Namens erstellt werden (z. B. Glutaminsäure, Glutamin, Glycin); darüber hinaus würde dies dem beabsichtigten System von einbuchstabigen Symbolen widersprechen. Daher haben wir Kompromisse eingegangen und die ersten Buchstaben werden nur in einigen Fällen als Symbole vorgeschlagen (Asparaginsäure, Glutaminsäure, Cystin (Halb-), Histidin, Methionin, Prolin, Serin, Tryptophan, Valin), in vielen anderen Fällen wurden charakteristische Symbole entweder aus der Schreibweise (ala- l, arg- r, lys- i, leu- u, ileu- w, phe- f) oder aus der grafischen Darstellung (glu- g, glu (NH $ _2 $)- q) abgeleitet gewählt.
Šorm war der erste, der „Q“ für Glutamin verwendete. (Neurath hatte „E“ sowohl für Glutamin als auch für Glutaminsäure verwendet.)
Neurath verwendete „O“ für Lysin und Šorm verwendete „I“.
Bis zur Auswahl durch die IUPAC wurde kein einheitliches System verwendet.