Charles, devenu roi, convoqua à nouveau le parlement en 1625. Le parlement n’a pas donné au roi ce que le roi voulait. Les hommes du parlement n’aimaient pas l’ami de Charles, George Villiers, 1er duc de Buckingham. Buckingham était parti avec Charles en Espagne et l’aida plus tard à épouser Henrietta Maria. Lorsque Buckingham mena la Royal Navy à attaquer Cadix en Espagne, la campagne fut un échec et le Parlement d’Angleterre le destitua. Pour cette raison, Charles a arrêté (dissous) le parlement. Il voulait également envoyer des soldats pour aider les protestants du Royaume de France et réclamait plus d’argent pour payer l’armée. Cette campagne fut également un échec, et le roi dut accepter la Pétition de droit en 1628. Un officier de l’armée a assassiné Buckingham cet été-là.
Le Parlement d’Angleterre se réunit à nouveau en 1629. Il y avait beaucoup de désaccords sur la religion et l’organisation de l’Église d’Angleterre. Charles a apporté son soutien au groupe de la « Haute Église », mais le parlement a apporté son soutien au groupe de la « Basse Église ». Charles a soutenu l’arminianisme, mais la Chambre des communes du Parlement a essayé de rendre l’arminianisme illégal. Pour arrêter la Chambre des communes, le roi dissout à nouveau le parlement. Certains députés de la Chambre des communes ont tenté de poursuivre leur session, mais le roi les a mis en prison. Charles continua à soutenir les Arminiens dans l’Église d’Angleterre, avec l’inclusion de William Laud, l’archevêque de Cantorbéry (l’évêque en chef de toute l’Angleterre). La population n’aimait pas Laud et les Arminiens, et n’aimait pas les impôts de Charles. Entre 1629 et 1640, le roi contrôle seul le gouvernement. Il n’y avait pas de parlement. Cette époque porte le nom de « Règle personnelle » ou de « Tyrannie de onze Ans ».
Cela rendait Charles très impopulaire auprès du peuple, qui n’aimait pas les différentes taxes qu’ils devaient payer directement au roi, car le Parlement ne pouvait voter pour lui accorder aucun budget. Beaucoup n’aimaient pas non plus le plus proche conseiller du roi, William Laud, qui essayait de forcer l’Église d’Angleterre à utiliser le même Livre de prières anglican et à arrêter les nombreuses autres confessions protestantes qui devenaient populaires à cette époque.
Lorsque le roi et l’archevêque ont alors tenté de forcer un Livre de prières sur l’Écosse, qui était encore plus protestante (calviniste), une rébellion armée y a éclaté. Les Guerres des Trois Royaumes ont commencé en 1639 avec les Guerres des évêques.
Les députés, en colère contre les choses qui se passaient depuis 11 ans, ne voulaient pas lui donner d’argent pour mener sa guerre. Au lieu de cela, ils ont passé la session à se plaindre de ce qui se passait dans le pays depuis 11 ans. Ainsi, après seulement trois semaines, Charles dissout à nouveau le Parlement. Pour cette raison, il était connu sous le nom de Court Parlement. Sans assez d’argent, Charles a mal perdu la guerre et a dû payer aux Écossais encore plus d’argent qu’il n’en avait pas.
Ces guerres sont un échec pour le roi, et sa position oblige Charles à convoquer le Parlement d’Angleterre en 1640. Le Parlement a voté que le roi devait convoquer le Parlement et ne pouvait plus les fermer. Charles n’avait d’autre choix que d’accepter. Ce Parlement est connu comme le Long Parlement, car il a duré vingt ans, jusqu’en 1660.
Charles était dans une position de faiblesse, et il a dû accepter des actes du parlement qui lui ont enlevé beaucoup de ses pouvoirs royaux. Laud et Thomas Wentworth, 1er comte de Strafford ont tous deux été destitués et ont ensuite été exécutés. Le Parlement est également fatigué de prendre le contrôle de l’armée loin du roi. De nombreux conservateurs politiques n’étaient pas satisfaits de ce plan. Sur les conseils de son épouse, la reine Maria Henrietta, le roi se rendit avec des soldats à la Chambre des communes en 1642 et tenta d’arrêter ses ennemis politiques. Ils étaient partis. Après cet échec, le roi a quitté Londres et est allé parcourir le pays pour chercher de l’aide. Avec une collection de ses amis politiques, Charles a commencé la guerre civile anglaise avec une armée à Nottingham, puis a déménagé à Oxford.
L’armée du Parlement a pris le dessus dans cette guerre, et Charles, après une défaite écrasante en 1646, est allé chercher la protection des Écossais. Ils décidèrent de le remettre au Parlement d’Angleterre en 1647.
La guerre fut un échec pour le roi, et Charles fut fait prisonnier. Le roi est sorti du palais de Hampton Court en 1647 et s’est enfui au château de Carisbrooke, sur l’île de Wight.
Le gouverneur de l’île de Wight était du côté du Parlement et fit de nouveau prisonnier le roi. Alors qu’il est détenu au château de Carisbrooke, Charles conclut un accord avec les Écossais qui se joignent à lui et les combats reprennent en 1648.
Les nombreux ennemis de Charles se sont ensuite battus entre eux au printemps 1648. Parce qu’il leur faisait encore des ennuis même pendant qu’il était capturé, le Parlement a voté pour que le roi soit jugé.
L’armée a ensuite retiré les conservateurs du parlement lors d’une purge politique en décembre pour éviter d’autres combats. Les hommes restés au parlement formèrent alors un tribunal afin de tenir un procès du roi. Le tribunal a condamné le roi à la peine de mort. Cela n’avait jamais été fait à un roi d’Angleterre auparavant.