Karl, jetzt der König, berief das Parlament 1625 erneut ein. Das Parlament gab dem König nicht, was der König wollte. Die Männer im Parlament mochten Karls Freund George Villiers, 1. Herzog von Buckingham, nicht. Buckingham war mit Charles nach Spanien gegangen und half ihm später, Henrietta Maria zu heiraten. Als Buckingham führte die Royal Navy Cadiz in Spanien anzugreifen, war die Kampagne ein Misserfolg, und das Parlament von England angeklagt ihn. Aus diesem Grund hielt Charles das Parlament auf (löste es auf). Er wollte auch Soldaten schicken, um Protestanten im Königreich Frankreich zu helfen, und forderte mehr Geld als Bezahlung für die Armee. Dieser Feldzug scheiterte ebenfalls, und der König musste 1628 der Petition von Right zustimmen. Ein Armeeoffizier ermordete Buckingham in diesem Sommer.
Das Parlament von England trat 1629 erneut zusammen. Es gab viele Meinungsverschiedenheiten über Religion und die Organisation der Kirche von England. Charles unterstützte die Gruppe „High Church“, aber das Parlament unterstützte die Gruppe „Low Church“. Charles unterstützte den Arminianismus, aber das Unterhaus des Parlaments versuchte, den Arminianismus illegal zu machen. Um das Unterhaus zu stoppen, löste der König das Parlament erneut auf. Einige Mitglieder des Parlaments im Unterhaus versuchten, ihre Sitzung fortzusetzen, aber der König brachte sie ins Gefängnis. Charles setzte fort, Arminians in der Kirche Englands (Kirche Englands), mit der Aufnahme von William Laud (William Laud), der Erzbischof von Canterbury (der Hauptbischof von ganz England (Bischof von ganz England)) zu unterstützen. Die Bevölkerung mochte Laud und die Arminianer nicht und mochte Karls Steuern nicht. Zwischen 1629 und 1640 kontrollierte der König die Regierung allein. Es gab kein Parlament. Diese Zeit hat den Namen „Persönliche Herrschaft“ oder „Elfjährige Tyrannei“.
Dies machte Karl sehr unbeliebt bei den Menschen, die die verschiedenen Steuern, die sie direkt an den König zahlen mussten, nicht mochten, da das Parlament nicht dafür stimmen konnte, ihm ein Budget zu geben. Viele mochten auch den engsten Berater des Königs, William Laud, nicht, der versuchte, die Church of England zu zwingen, dasselbe anglikanische Gebetbuch zu verwenden und die vielen anderen protestantischen Konfessionen zu stoppen, die zu dieser Zeit populär wurden.
Als der König und der Erzbischof dann versuchten, dem noch protestantischeren (calvinistischen) Schottland ein Gebetbuch aufzuzwingen, brach dort ein bewaffneter Aufstand aus. Die Kriege der Drei Königreiche begannen 1639 mit den Bischofskriegen.
Die Abgeordneten, wütend auf die Dinge, die seit 11 Jahren vor sich gingen, wollten ihm kein Geld geben, um seinen Krieg zu führen. Stattdessen verbrachten sie die Sitzung damit, sich darüber zu beschweren, was in den letzten 11 Jahren im Land vor sich gegangen war. Nach nur drei Wochen löste Charles das Parlament erneut auf. Aus diesem Grund wurde es als das kurze Parlament bekannt. Ohne genug Geld verlor Charles den Krieg schwer und musste den Schotten noch mehr Geld zahlen, als er nicht hatte.
Diese Kriege waren ein Misserfolg für den König, und seine Position zwang Charles, das Parlament von England 1640 einzuberufen. Das Parlament stimmte dafür, dass der König das Parlament einberufen musste und sie nicht wieder schließen konnte. Charles hatte keine andere Wahl, als zuzustimmen. Dieses Parlament ist als Langes Parlament bekannt, weil es zwanzig Jahre bis 1660 dauerte.
Karl befand sich in einer schwachen Position und musste Parlamentsakten zustimmen, die viele seiner königlichen Befugnisse wegnahmen. Laud und Thomas Wentworth, 1. Earl of Strafford wurden beide angeklagt und später hingerichtet. Das Parlament wollte auch die Kontrolle über die Armee vom König wegnehmen. Viele politische Konservative waren mit diesem Plan nicht zufrieden. Auf Anraten seiner Frau Königin Maria Henrietta ging der König 1642 mit Soldaten ins Unterhaus und versuchte, seine politischen Feinde zu verhaften. Sie waren gegangen. Nach diesem Misserfolg verließ der König London und reiste durch das Land, um Hilfe zu suchen. Mit einer Sammlung seiner politischen Freunde begann Charles den englischen Bürgerkrieg mit einer Armee in Nottingham und zog dann nach Oxford.
Die Armee des Parlaments gewann in diesem Krieg die Oberhand, und Karl ging nach einer vernichtenden Niederlage im Jahre 1646 zu den Schotten, um Schutz zu suchen. Sie beschlossen, ihn 1647 dem englischen Parlament zu übergeben.
Der Krieg war ein Fehlschlag für den König, und Karl wurde gefangen genommen. Der König verließ 1647 den Hampton Court Palace und rannte nach Carisbrooke Castle auf der Isle of Wight.
Der Gouverneur der Isle of Wight war auf der Seite des Parlaments und machte den König wieder gefangen. Während er in Carisbrooke Castle festgehalten wurde, schloss Charles eine Vereinbarung mit den Schotten, die sich seiner Seite anschlossen, und die Kämpfe begannen 1648 erneut.
Karls viele Feinde kämpften dann im Frühjahr 1648 untereinander. Weil er ihnen immer noch Probleme bereitete, während er gefangen genommen wurde, stimmte das Parlament dafür, den König vor Gericht zu stellen.
Die Armee entfernte dann die Konservativen im Dezember in einer politischen Säuberung aus dem Parlament, um weitere Kämpfe zu verhindern. Die im Parlament verbliebenen Männer bildeten dann ein Gericht, um einen Prozess gegen den König abzuhalten. Das Gericht verhängte gegen den König die Todesstrafe. Dies war noch nie zuvor einem König von England angetan worden.