hogyan kell írni a módszereket

biztosítsa a megértést, a reprodukálhatóságot és a replikálhatóságot

mit kell tartalmaznia a módszerek részben, és mennyi részlet megfelelő?

miért számítanak a módszerek

a módszerek szakasz egykor a legvalószínűbb része volt egy cikknek, amelyet igazságtalanul rövidítettek, túlzottan összefoglaltak, vagy akár a kiadó weboldalának nehezen megtalálható részeire szorítottak. Míg egyes folyóiratok felelősségteljesen a módszerek részletesebb elemeit is belefoglalhatják a kiegészítő szakaszokba, a tudomány fokozott reprodukálhatóságáért és szigorúságáért folytatott mozgalom visszaállította a módszerek szakasz fontosságát. A módszerek ma már kulcsfontosságúak a bejelentett kutatás hitelességének megállapításában, az adatok és eredmények nyílt hozzáférhetősége mellett.

a clear methods rész hatással van a szerkesztői értékelésre és az olvasók megértésére, és egyben az átláthatóság és a megismételhetőség gerincét is jelenti.

például a reprodukálhatósági projekt: A rákbiológiai projekt 2013-ban indult, hogy 50 nagy horderejű rákdokumentum kísérleteit megismételje, de 18 cikkre módosította a céljukat, miután megértették, hogy mennyi módszertani részlet nem szerepel az eredeti dokumentumokban.

mit kell tartalmaznia a módszerek szakaszban

mit tartalmaz a módszerek szakaszokban attól függ, hogy milyen területen van, és milyen kísérleteket hajt végre. Azonban, a folyóiratok többségében alkalmazott általános elvet jól összefoglalják a PLOS ONE irányelvei: “Az anyagok és módszerek szakasznak elegendő részletet kell tartalmaznia ahhoz, hogy a megfelelően képzett nyomozók teljes mértékben megismételhessék a tanulmányt.”A hangsúlyok itt szándékosak: a módszereknek lehetővé kell tenniük az olvasók számára, hogy megértsék a dolgozatot, és megismételjék a tanulmányt. Azonban nem kell belemenni a részletesség szintjébe, amelyet egy laikus ember megkövetelne—a hangsúly az olvasóra irányul, aki szintén képzett az Ön területén, megfelelő készségekkel és ismeretekkel a replikáció megkísérléséhez.

a szigorú tudomány állandó elve

a módszerek szakasz, amely lehetővé teszi más kutatók számára, hogy megértsék és megismételjék az eredményeket, a szigorú, átlátható és nyílt tudomány állandó elve. Célja, hogy alapos legyen, még akkor is, ha egy adott folyóirat nem igényel azonos szintű részletességet . A reprodukálhatóság mindannyiunk felelőssége. Nem okozhat problémát a minimális információszint túllépésével. Ha egy naplónak még mindig vannak szókorlátjai—akár a teljes cikkre, akár az egyes szakaszokra vonatkozóan—, és bizonyos módszertani részleteket egy kiegészítő szakaszban kell feltüntetni, az rendben van, amíg az extra részletek kereshetők és megtalálhatók.

Imagine replikating your own works, years in the future

a PLOS Reprodukálhatóságról és nyílt közzétételről szóló előadásának részeként (az UCSF reprodukálhatósági sorozatának része) azt javasoljuk, hogy a módszerek részben tervezze meg a részletek szintjét úgy, hogy elképzeli, hogy a jövőbeli önmagának ír, saját munkáját replikálja. Ha figyelembe vesszük, hogy lehet, hogy egy másik intézmény, különböző fiók bejelentkezési, alkalmazások, erőforrások és hozzáférési szintek—segíthet magának elképzelni, hogy milyen szintű specificitás, hogy te magad lenne szükség, hogy újra a pontos kísérlet. Fontolja meg:

• mely részletekre kell emlékeztetni?
• melyik sejtvonalat, antitestet, szoftvert vagy reagenst használta, és rendelkezik-e kutatási erőforrás-azonosítóval (Rrid), amelyet idézhet?
• a kérdőív melyik verzióját használta a felmérésben?
• pontosan milyen vizuális ingert mutatott a résztvevőknek, és nyilvánosan elérhető-e?
• milyen résztvevőket döntött úgy, hogy kizárja?
• milyen folyamatot igazítottál a munkád során?

a módszerek vizuális segédeszközei segítenek a teljes papír elolvasásában

fontolja meg, hogy a módszerek vizuális ábrázolása megfelelő-e, vagy segít-e megérteni a folyamatot. A vizuális referencia olvasók könnyen visszatérhetnek, mint egy folyamatábra, döntési fa, vagy ellenőrzőlista, segíthet az olvasóknak a teljes cikk jobb megértésében, nem csak a módszerek részben.

etikai megfontolások

amellett, hogy leírja, mit tett, ugyanolyan fontos biztosítani az olvasókat, hogy a kutatás során minden vonatkozó etikai irányelvet betartott. Míg az etikai normákat és a jelentési irányelveket gyakran külön fejezetben mutatják be, győződjön meg arról, hogy módszerei és protokolljai valóban követik ezeket az irányelveket. További információ az etikáról.

meglévő szabványok, ellenőrző listák, Irányelvek, partnerek

míg a módszerek részben szereplő részletesség szintjét a szigorú tudomány fent vázolt egyetemes elveinek kell vezérelniük, a különféle tudományterületek, területek és projektek keményen dolgoztak következetes szabványok, irányelvek és eszközök tervezésén és kidolgozásán, amelyek segítenek minden típusú kísérlet jelentésében. Az alábbiakban néhány kulcsfontosságú kezdeményezést talál. Győződjön meg róla, hogy olvassa el az adott folyóirat benyújtási irányelveit, annak érdekében, hogy felfedezzen minden további naplót – vagy terepspecifikus irányelveket, vagy kezdeményezéseket/eszközöket.

randomizált, kontrollált vizsgálatok – CONSORT
a Consort (Consort) projekt különféle kezdeményezéseket ölel fel, amelyek célja A randomizált, kontrollált vizsgálatok nem megfelelő jelentésének problémáinak megelőzése. Az elsődleges kezdeményezés egy bizonyítékokon alapuló minimális ajánláskészlet a randomizált vizsgálatok jelentésére, az úgynevezett CONSORT nyilatkozat.

szisztematikus áttekintések és metaanalízisek-PRISMA
a szisztematikus áttekintések és metaanalízisek előnyben részesített jelentési tételei (PRISMA) egy bizonyítékokon alapuló minimális tételkészlet, amely a randomizált vizsgálatokat és más típusú kutatásokat értékelő felülvizsgálatok jelentésére összpontosít.

kutatás állatok felhasználásával – érkezés
az állatkísérletek: in Vivo kísérletek jelentése (ARRIVE) Irányelvek ösztönzik az állatok felhasználásával végzett kutatásban jelentett információk maximalizálását, ezáltal minimalizálva a felesleges vizsgálatokat. (Eredeti tanulmány és javaslat, valamint frissített iránymutatások a PLOS Biology – ban.)

laboratóriumi protokollok
Protocols.io kifejlesztett egy olyan platformot, amely kifejezetten a laboratóriumi protokollok megosztására és frissítésére szolgál, amelyek saját DOI-t rendelnek hozzá, és a reprodukálhatóság növelése érdekében összekapcsolhatók a módszerek szekcióival.

az anyagok, a tervezés és az elemzés következetes jelentése – az MDAR ellenőrző lista
szerkesztők és szakértők egy kiadók közötti csoportja kifejlesztett, tesztelt és kidolgozott egy ellenőrző listát, amely segít az élettudományok jelentési szabványainak kialakításában és harmonizálásában. Az ellenőrzőlista, amelyet a szerzők használhatnak módszereik összeállításához, a szerkesztők/bírálók pedig a módszerek ellenőrzéséhez, minimális követelményeket állapít meg az átlátható jelentésekben, és alkalmazható az élettudományok bármely tudományágához, a potenciálisan releváns módszertani elemek és megfontolások széles körének lefedésével. Ha a Life Sciences és írásban fel a módszerek részben, próbálja meg dolgozni a MDAR ellenőrzőlista, és nézd meg, hogy ez segít, hogy tartalmazza az összes lényeges részleteket a módszerek, és hogy emlékeztette Önt bármi lehet, hogy kimaradt egyébként.

összefoglaló írási tippek

a módszerek írásakor a fő kihívás az, hogy olvasható legyen, és lefedje a reprodukálhatósághoz és a replikálhatósághoz szükséges összes részletet. Bár ez nehéz, ne kössön kompromisszumot a hitelesség szigorú előírásaival kapcsolatban!

Do

• tartsa szem előtt a jövőbeli reprodukálhatóságot, a megértés és az olvashatóság mellett.
• kövesse az ellenőrző listákat, valamint a mező – és naplóspecifikus irányelveket.
• fontolja meg a szigorú és átlátható tudomány iránti elkötelezettséget személyes felelősségként, és nem csak a folyóirat irányelveinek betartásával.
• ellenőrizze, hogy vannak-e állandó azonosítók az Ön által használt kutatási erőforrásokhoz, amelyek kifejezetten idézhetők a módszerek szakaszban.
• helyezze be a laboratóriumi protokollokat Protocols.io állandó kapcsolatot létesíteni velük. A protokollokat később frissítheti, ha javítja őket, csakúgy, mint a jövőbeli tudósok, akik követik a protokollokat.
• fontolja meg a vizuális segédeszközöket, például folyamatábrákat, listákat, amelyek segítenek a papír más részeinek olvasásában.
• legyen konkrét a kísérletek során hozott összes döntésről, amelyet valakinek tudnia kell a munkád reprodukálásáról.

ne

• összefoglalja vagy rövidítse a módszereket anélkül, hogy teljes részleteket adna meg egy felfedezhető kiegészítő részben.
• tegyük fel, hogy mindig emlékezni fog arra, hogyan végezte el a kísérleteket, vagy hozzáférhet magán-vagy intézményi jegyzetfüzetekhez és erőforrásokhoz.
• kísérlet arra, hogy elrejtse a kényszereket vagy a nem optimális döntéseket, amelyeket meg kellett tennie-az átláthatóság a kulcs a kutatás hitelességének biztosításához.