Proteiner er relativt store og komplekse molekyler som er essensielle for livet. De er klassifisert som biomolekyler-sammen med karbohydrater OG DNA OG RNA, andre molekyler som er nødvendige for livet.
Proteiner er i hovedsak polymerer – det vil si at De består av visse byggeklosser som bare brukes om og om igjen langs molekylets kjede, i dette tilfellet protein. Disse byggesteinene, eller monomerer, i tilfelle av proteiner er molekyler referert til som aminosyrer. Ved å bryte ned dette navnet, kan det utledes hva det er laget av – amino refererer til aminogruppen (- NH2), og syre til karboksylsyregruppen (-COOH).
aminoen er en base, MENS COOH er en syre. Aminogruppen kan protoneres for å danne-NH3+. I mellomtiden kan syregruppen, COOH, deprotoneres for å danne konjugatbasen-COO -. Aminosyrer ved fysiologisk pH (rundt 7) vil ha denne formen. De er nøytrale, men inneholder like mange positive og negative ladninger – de er zwitterions.
disse to funksjonelle gruppene er koblet til et sentralt alfa-karbon. Det er 20 aminosyrer som er avgjørende for livet. Av disse 20, 19 har en kiralt alfa karbon. Tilstedeværelsen av dette kirale senteret gjør aminosyrer asymmetriske, og er ikke-superimposable med speilbilder. Enkelt sagt vil et karbon være chiralt hvis det er festet til fire unike grupper. Som nevnt er 19 av de essensielle aminosyrene chirale og har dermed et sentralt alfa-karbon festet til 4 forskjellige grupper. De to første gruppene er de to viktigste funksjonelle gruppene som utgjør aminosyrer. De to andre er 1) et hydrogen, og 2) En R-gruppe referert til som en sidekjede. Den eneste aminosyren som ikke har et kiralt karbon er glycin, fordi R-gruppen er et annet hydrogen.
så langt er det tydelig at aminosyrer består av atomer av karbon (C), hydrogen (H), oksygen (O) og nitrogen (N). Faktisk utgjør dette de fleste proteiner. Det eneste andre atomet som kan finnes i proteiner er svovel (Er) og det er tilstede i sidekjeden av to aminosyrer, nemlig cystein og metionin.
kort sagt består proteiner av monomerer kalt aminosyrer. Disse aminosyrene er molekyler som består av atomer av karbon, hydrogen, nitrogen, oksygen og i noen tilfeller svovel. Aminosyrer, monomerene, er koblet via peptidbindinger, for å danne polymeren som er proteinet.