Harvardin-kaudellaan Murray istui Alfred North Whiteheadin luennoilla, joiden prosessifilosofia leimasi hänen filosofista ja metafyysistä ajatteluaan koko hänen ammattilaisuransa ajan.
vuonna 1927, 33-vuotiaana, Murraysta tuli Harvardin psykologisen klinikan apulaisjohtaja. Hän kehitti käsitteet piilevät tarpeet (ei avoimesti esillä), ilmeiset tarpeet (havaittu ihmisten toiminnassa), ”Lehdistö” (ulkoiset vaikutteet motivaatioon) ja ”thema”—”lehdistön ja tarpeen malli, joka tiivistyy tiettyjen vuorovaikutusten ympärille”.
Murray teki yhteistyötä lääketieteellisen tiedekunnan neuropatologian Bullardin professorin Stanley Cobbin kanssa, jotta psykoanalyysi otettaisiin Harvardin opetussuunnitelmaan, mutta jotta sitä opettaneet pysyisivät poissa Wienin päätöksentekokoneistosta. Hän ja Cobb loivat perustan Bostonin psykoanalyyttisen seuran perustamiselle vuoden 1931 jälkeen, mutta molemmat suljettiin pois jäsenyydestä poliittisin perustein.
vuonna 1935 Murray ja Morgan kehittivät apperception käsitteen ja olettamuksen, jonka mukaan jokaisen ajattelu on subjektiivisten prosessien muovaamaa, temaattisen apperception testin perustelut. He käyttivät termiä ”apperception” viitatakseen fantasiakuvaston projisoimiseen objektiiviseen ärsykkeeseen.
vuonna 1937 Murraysta tuli Harvardin psykologisen klinikan johtaja. Vuonna 1938 hän julkaisi psykologian klassikon Explorations in Personality, joka sisältää kuvauksen temaattisesta Apperception Test-kokeesta. Vuonna 1938 Murray toimi Britannian hallituksen konsulttina ja perusti upseerien valintalautakunnan. Murrayn työ Harvardin psykologisella klinikalla mahdollisti hänen teorioidensa soveltamisen valintaprosessien suunnittelussa” tilannetestillä”, käytännön tehtäviin ja toimintaan perustuvalla arvioinnilla, tiettyjen kriteerien (esim.” johtajuus”) analysoinnilla useiden rataajien toimesta eri toiminnoissa. Tulokset yhdistettiin kokonaisarvion tekemiseksi.
Toinen Maailmansota, Office of Strategic Services, 1939 – 45edit
toisen maailmansodan aikana hän lähti Harvardista ja työskenteli everstiluutnanttina Office of Strategic Servicesille (OSS). James Miller, joka vastasi salaisten agenttien valinnasta oss: ssä toisen maailmansodan aikana, sanoi tilannetestin käyttäneen Britannian Sotaupseerien Valintalautakuntaa ja OSS: ää mahdollisten agenttien arvioimiseen.
vuonna 1943 Murray auttoi OSS-pomo Mgenin toimeksiannosta Adolf Hitlerin persoonallisuuden täydellistä analysointia. William ”Wild Bill” Donovan. Raportti on tehty yhteistyössä psykoanalyytikko Walter C. Langerin, new School for Social Researchin tohtori Ernst Krisin ja New Yorkin psykoanalyyttisen instituutin tohtori Bertram D. Lewinin kanssa. Raportti käytti monia lähteitä profiloidakseen Hitlerin, mukaan lukien tiedonantajia kuten Ernst Hanfstaengl, Hermann Rauschning, prinsessa Stephanie von Hohenlohe, Gregor Strasser, Friedelinde Wagner ja Kurt Ludecke. Uraauurtava tutkimus oli rikoksentekijäprofiloinnin ja poliittisen psykologian uranuurtaja. Sen lisäksi, että Murray ennusti, että Hitler valitsisi itsemurhan, jos tappio Saksalle olisi lähellä, hän totesi yhteistyöraportissaan, että Hitler oli voimaton heteroseksuaalisten suhteiden suhteen ja että oli mahdollista, että Hitler oli osallistunut homoseksuaaliseen suhteeseen. Raportissa sanottiin: ”käsitys siitä, että Hitler on homoseksuaali, on todennäköisesti kehittynyt a) siitä, että hänellä on niin monia naisellisia piirteitä, ja b) siitä, että puolueessa oli niin paljon homoseksuaaleja alkuaikoina ja monet ovat edelleen tärkeissä asemissa. On luultavasti totta, että Hitler kutsuu Albert Forsteria nimellä ”Bubi”, joka on yleinen lempinimi, jota homoseksuaalit käyttävät puhuessaan kumppaneilleen.”
Harvard human experiments, 1959-62Edit
vuonna 1947 hän palasi Harvardiin päätutkijaksi, luennoi ja perusti muiden kanssa psykologisen klinikan liitteen.
vuoden 1959 lopusta vuoden 1962 alkuun Murray oli vastuussa epäeettisistä kokeista, joissa hän käytti tutkimuskohteinaan kaksikymmentäkaksi Harvardin ylioppilasta. Kokeissa pyrittiin muun muassa mittaamaan yksilöiden reaktioita äärimmäiseen stressiin. The unwitting undergraduates alistettiin mitä Murray kutsui ”vehement, lakaistaan ja henkilökohtaisesti loukkaava” hyökkäyksiä. Erityisesti-räätälöityjä hyökkäyksiä heidän egonsa, vaalia ideoita ja uskomuksia käytettiin aiheuttaa suurta stressiä ja ahdistusta. Tämän jälkeen koehenkilöt katsoivat nauhoitettua kuvamateriaalia siitä, miten he reagoivat tähän sanalliseen solvaukseen toistuvasti.
heidän joukossaan oli 17-vuotias Ted Kaczynski, matemaatikko, josta tuli Unabomber-niminen kotimainen terroristi, jonka kohteena olivat akateemikot ja teknikot 18 vuoden ajan. Alston Chasen kirja Harvard and the Unabomber: Amerikkalaisen terroristin koulutus yhdistää Kaczynskin hyväksikäyttökokemukset Murrayn alaisuudessa hänen myöhempään rikollisuraansa.
vuonna 1960 Timothy Leary aloitti Harvardissa psykedeelisten huumeiden tutkimuksen, jota Murrayn sanotaan valvoneen.