i sin periode på Harvard sad Murray i foredrag af Alfred North hvidhoved, hvis procesfilosofi markerede hans filosofiske og metafysiske tænkning gennem hele sin professionelle karriere.
i 1927, i en alder af 33, blev Murray assisterende direktør for Harvard Psychological Clinic. Han udviklede begreberne latente behov (ikke åbent vist), åbenbare behov (observeret i folks handlinger), “presse” (ekstern indflydelse på motivation) og “thema”—”et mønster af presse og behov, der samles omkring bestemte interaktioner”.
Murray samarbejdede med Stanley Cobb, Bullard-Professor i neuropatologi ved medicinsk skole, for at introducere psykoanalyse i Harvard-læseplanen, men for at holde dem, der lærte det væk fra beslutningstagningsapparatet i Vienna. Han og Cobb satte scenen for grundlæggelsen af Boston Psychoanalytic Society efter 1931, men begge blev udelukket fra medlemskab af politiske grunde.
i 1935 udviklede Murray og Morgan begrebet apperception og antagelsen om, at alles tænkning er formet af subjektive processer, begrundelsen bag den tematiske apperceptionstest. De brugte udtrykket” apperception ” til at henvise til processen med at projicere fantasibilleder på en objektiv stimulus.
i 1937 blev Murray direktør for Harvard Psychological Clinic. I 1938 offentliggjorde han udforskninger i personlighed, en klassiker i psykologi, som inkluderer en beskrivelse af den tematiske Apperceptionstest. I 1938 fungerede Murray som konsulent for den britiske regering og oprettede Officer Selection Board. Murrays arbejde på Harvard Psychological Clinic gjorde det muligt for ham at anvende sine teorier i udformningen af udvælgelsesprocesserne med en “situationstest”, en vurdering baseret på praktiske opgaver og aktiviteter, en analyse af specifikke kriterier (f.eks. Resultaterne blev samlet for at opnå en samlet vurdering.
Anden Verdenskrig, Office of Strategic Services, 1939-45edit
under Anden Verdenskrig forlod han Harvard og arbejdede som oberstløjtnant for Office of Strategic Services (OSS). James Miller, der var ansvarlig for udvælgelsen af hemmelige agenter på OSS under Anden Verdenskrig, sagde, at situationstesten blev brugt af den britiske Krigsofficer Selection Board og OSS til at vurdere potentielle agenter.
i 1943 Murray hjalp komplet analyse af personlighed Adolph Hitler, bestilt af OSS chef MGen. Vilhelm” Vilde Bill ” Donovan. Rapporten blev udført i samarbejde med psykoanalytiker C. Langer, Dr. Ernst Kris, ny skole for Social forskning, og Dr. Bertram D. Rapporten brugte mange kilder til at profilere Hitler, herunder informanter som Ernst Hanfstaengl, Hermann Rauschning, prinsesse Stephanie von Hohenlohe, Gregor Strasser, Friedelinde og Kurt Ludecke. Den banebrydende undersøgelse var pioner inden for lovovertræderprofilering og politisk psykologi. Ud over at forudsige, at Hitler ville vælge selvmord, hvis nederlaget for Tyskland var nær, sagde Murrays samarbejdsrapport, at Hitler var impotent for så vidt angår heteroseksuelle forhold, og at der var en mulighed for, at Hitler havde deltaget i et homoseksuelt forhold. Rapporten sagde: “troen på, at Hitler er homoseksuel, har sandsynligvis udviklet sig (A) fra det faktum, at han viser så mange feminine egenskaber, og (b) fra det faktum, at der var så mange homoseksuelle i partiet i de tidlige dage, og mange fortsætter med at indtage vigtige positioner. Det er sandsynligvis sandt, at Hitler kalder Albert Forster” Bubi”, som er et almindeligt kaldenavn, der anvendes af homoseksuelle til at henvende sig til deres partnere.”
Harvard menneskelige eksperimenter, 1959-62edit
i 1947 vendte han tilbage til Harvard som chefforsker, foredragte og etablerede sammen med andre Det Psykologiske Klinikbilag.
fra slutningen af 1959 til begyndelsen af 1962 var Murray ansvarlig for uetiske eksperimenter, hvor han brugte toogtyve Harvard-studerende som forskningsemner. Blandt andre mål forsøgte eksperimenter at måle individers reaktioner på ekstrem stress. De uvidende studerende blev underkastet det, Murray kaldte” heftige, fejende og personligt voldelige ” angreb. Specielt skræddersyede angreb på deres egoer, elskede ideer og overbevisninger blev brugt til at forårsage høje niveauer af stress og nød. Forsøgspersonerne så derefter optagede optagelser af deres reaktioner på dette verbale misbrug gentagne gange.
blandt dem var 17-årige Ted Kacsynski, en matematiker, der fortsatte med at blive Unabomber, en indenlandsk terrorist rettet mod akademikere og teknologer i 18 år. Alston Chase ‘ s bog Harvard og Unabomber: Uddannelsen af en amerikansk Terrorist forbinder Murrays voldelige oplevelser med hans senere kriminelle karriere.
i 1960 startede Timothy Leary forskning i psykedeliske stoffer ved Harvard, som Murray siges at have overvåget.