Šorm et al. ont été les premiers à publier un système d »abréviations à une lettre spécifique, dans On proteins. LXIII. Les structures inférieures dans les chaînes de protéines s’accumulent. Tchèque. Chem. Commun. 1961, 26, 531-578.
Dans cette publication, un système antérieur, inédit, de Hans Neurath a également été publié.
Si des symboles pratiques doivent être proposés, ils doivent être conformes aux exigences suivantes: (l) il faut choisir 23 symboles d’une lettre différents d’acides aminés présents dans les structures protéiques, (2) il faut utiliser uniquement des symboles simples actuellement accessibles dans les imprimeries avec la possibilité d’être écrits par des machines à écrire courantes, (3) les symboles doivent offrir la possibilité d’exprimer si la liaison de la séquence est déterminée ou, à défaut, jusqu’à présent indéterminée, dans l’espace d’une seule lettre, et (4) l’utilisation de symboles doit être d’application internationale.
L’utilisation de chiffres est exclue par l’exigence (1), et l’utilisation de lettres et symboles grecs ou autres lettres et symboles peu communs par l’exigence (2). La manière la plus appropriée semble être l’utilisation des lettres communes de l’alphabet latin, qui est conforme à l’exigence (4) et permet de distinguer selon (3) des séquences déterminées et indéterminées en choisissant soit des majuscules, soit des minuscules. Pour exprimer une séquence déterminée de la chaîne peptidique, nous proposons d’utiliser des majuscules selon le tableau VIII, et, en outre, de mettre des minuscules aux endroits où des crochets et des virgules ont été utilisés jusqu’à présent. Nos symboles sont dérivés des noms anglais des acides aminés. Comme, cependant, des lettres identiques se reproduisent couramment au début des noms, elles ne pouvaient pas être utilisées de manière cohérente dans nos symboles. Il n’a pas non plus été possible de compiler un système complet impliquant des symboles à deux lettres des deux premières lettres du nom (par exemple acide glutamique, glutamine, glycine); de plus, cela serait contradictoire avec le système prévu de symboles à une lettre. Par conséquent, nous avons compromis et les premières lettres ne sont proposées comme symboles que dans certains cas (acide asparatique, acide glutamique, cystine (demi-), histidine, méthionine, proline, sérine, tryptophane, valine), dans de nombreux autres cas des symboles caractéristiques dérivés soit de l’orthographe (ala-l, arg-r, lys-i, leu-u, ileu-w, phe-f) soit de la représentation graphique (glu-g, glu (NH$_2 q) -q) ont été choisis.
Šorm a été le premier à utiliser « Q » pour la glutamine. (Neurath avait utilisé « E » pour la glutamine et l’acide glutamique.)
Neurath a utilisé « O » pour la lysine et Šorm a utilisé « I ».
Aucun système unifié n’a été utilisé jusqu’à la sélection par l’UICPA.