det har vært økende bekymringer om helsemessige forhold og tilgang til helsetjenester som antall Sør-Sudan flyktninger inn Uganda fortsetter å øke, spesielt Bidi Bidi flyktningleir, Med Reuters rapporterer at 180 flyktninger (nesten halvparten av dem små barn) døde I Bidibidi Flyktningleir i De første seks månedene Av 2017. Dette forsterkes av hvordan det ofte er begrenset nøyaktighet av helsemålinger i leirinnstillinger, med underrapportering av dødsfall av humanitære organisasjoner som vanligvis forekommer oftere enn overrapportering av dødsfall.
fra et menneskerettighets-og etikkperspektiv er det også spørsmål om hvorvidt personer med ulike fysiske evner eller eldre ikke prioriteres i disse bosetningene, og får mindre ressurser sammenlignet med yngre, funksjonsfriske innbyggere med god helse. I bosetninger som ligger I Ayilo-Distriktet I Nord-Uganda, rapporterer Organisasjonen Caritas at programmer er utviklet for å gi mer hjelp til å bygge latriner til grupper identifisert som sårbare, for eksempel eldre innbyggere, funksjonshemmede innbyggere og barnhårede husholdninger.
videre en 2016 USA Utenriksdepartementets rapport om menneskehandel advarer Om At sørsudanske barn I Nordlige Ugandiske flyktningbosetninger kan være sårbare for menneskehandel, MED UNHCR mistenker at tilfeller av menneskehandel allerede forekommer blant unge Sørsudanske flyktninger. Dessverre, pålitelig kvantifisering av antall menneskehandel barn kan være en utfordring på grunn av mangel på effektiv overvåking, korrupsjon, utilstrekkelig beskyttelse av ofrene til å komme frem, forskjeller i definisjoner av begreper, og andre kontekstuelle aspekter.