da USA gik ind I Første Verdenskrig i 1917, fik Pershing kommandoen over den amerikanske ekspeditionsstyrke.
dette var ikke et godt tidspunkt for en krig for hæren. Der var begrænsede forsyninger, ingen fly til en hær, der stadig kæmper med rekruttering og organisering.
der var også et diplomatisk bjerg at skalere: franskmændene og briterne forventede, at amerikanerne skulle tjene under deres kommandoer. Pershing nægtede og krævede med succes separate lejre for sine mænd såvel som træning af amerikanske officerer og sergenter.
i juni 1918 lancerede tyskerne en større offensiv for at erobre vigtige broovergange ved Marne-floden i Frankrig. I løbet af måneden førte den amerikanske ekspeditionsstyrke defensiv og modoffensiv krigsførelse mod tyskerne i det blodige slag ved Belleau Træ.
i midten af juli blev den amerikanske ekspeditionsstyrke igen testet i Slaget ved Chateau-Thierry. Sejre i begge disse engagementer førte til afslutningen af den sidste store tyske offensiv i krigen.
i September 1918 førte Pershing med succes amerikanske og franske styrker i en offensiv mod den tyske linje i Saint-Mihiel fremtrædende. Denne sejr beviste de amerikanske troppers kompetence og kvalitet og blev efterfulgt af krigens sidste offensiv, Meuse-Argonne.
de allieredes troppers langsomme, blodige fremrykning skred frem til den 11.November 1918, da en våbenhvile endelig blev erklæret.