vuonna 1671 Tanskan Länsi-Intian kauppakomppania sai kuningas Kristian V: ltä määräyksen miehittää ja ottaa haltuunsa St. Thomasin ja siellä olevat saaret, jotka saattoivat olla asumattomia ja soveltuvia plantaaseille. Osassa peruskirjaa todettiin, että Tanskan hallitus toimittaisi yhtiölle niin monta miesvankia kuin on tarpeen plantaaseilla työskentelyyn ja niin monta pidätettyä naista kuin on tarpeen. Viranomaiset saisivat pian tietää, että vangit eivät olleet hyviä työntekijöitä! St. Tuomas ottaisi nopeasti vastaan uudisasukkaat muilta lähisaarilta ja turvautuisi afrikkalaisiin orjiin työvoimana.
kaksi ensimmäistä laivaa, jotka lähtivät purjehtimaan St. Thomasia vastaan, lähtivät matkaan 30.elokuuta 1671 ja saapuivat kolme kuukautta myöhemmin 26. helmikuuta 1672. Alkuperäiseen miehistöön kuului 116 komppanian palvelukseen ottamaa miestä ja 61 tuomittua. Ensimmäiset kuukaudet ja Vuodet asuttamisessa tulivat ihmishenkien kannalta kalliiksi. Kahdella ensimmäisellä seilanneella laivalla kuoli 89 ihmistä ja 75 kuoli maihinnousun jälkeen. Kolmas laiva, jossa oli 67 matkustajaa, purjehti St. Thomasiin vuonna 1673; 7 kuoli aluksella ja 53 laskeutumisen jälkeen! Näillä synkillä luvuilla pieni tanskalaisasutus St. Thomasilla kasvoi hitaasti. Monet hollantilaiset uudisasukkaat tulivat naapurisaarilta, joten Hollanti oli alusta asti hallitseva kieli. Vuonna 1673 lähetettiin 103 orjan laiva St. Thomasiin, vuonna 1675 lisättiin vielä 24 ja vuonna 1678 16. Nämä olivat ensimmäiset monista saarelle tuoduista orjista.
vuoden 1680 väestönlaskennassa valkoisia oli 156 ja mustia 175. Asutus käsitti yhden linnoituksen, yhden saaren läpi kulkevan tien ja noin 50 plantaasia (joista 46 oli miehitettyjä). St. Thomasin ympärillä olevia naapurisaaria, kuten Buck Islandia ja Water Islandia, käytettiin vuohien ja lampaiden laitumina; tarkoituksena oli ruokkia St. Thomasin uudisasukkaita.
Taphus
jonkin ajan kuluttua hallitus tajusi, että suuri osa Pyhän tuomaan tulevaisuudesta oli luonnonsatamaa ympäröivän alueen kehittämisessä. Pian syntyi Taphus! Taphus, joka tarkoittaa oluttaloja tai halleja, oli nykyisen Charlotte Amalien nimi. Jälkimmäistä nimeä käytettiin kuningas Kristian V: n vaimon kunniaksi. Kun maaherra antoi asukkaille lupia sataman ympäristön kehittämiseksi, kapakoita syntyi nopeasti samoin kuin Tafusta nauttivia merenkulkijoita.
Seafarers … pirates! St. Thomasin 2.ja 3. kuvernöörinä toimineiden Esmitin veljesten alaisuudessa saari sai kuvan merirosvoluolasta. Tämä ei ole yllättävää ottaen huomioon, että Esmitin veljesten sanotaan käyneen laittomasti ja avoimesti kauppaa vapaamatkustajien kanssa ja sallineen heidän käyttää St. Thomasia turvapaikkana. Romantisoidut tarinat merirosvoudesta St. Thomasilla ovat yleisiä; tarinat merirosvoista Mustaparta ja Siniparta ovat tunnetuimpia.
vuonna 1685 Tanskan Länsi-Intian kauppakomppania solmi Brandenburger-kauppakomppanian kanssa sopimuksen, joka salli heidän perustaa orjakaupan St. Thomasille. Vaikka orjakauppa oli suurta liiketoimintaa, Bradenburgerin raporttien mukaan heidän vaurauttaan haittasivat vaikeudet tanskalaisten isäntien kanssa ja konfliktit Hollannin Länsi-Intian kauppakomppanian kanssa.
1700-luvun alku
1700-luvun alku oli St. Thomas, sokerista tuli suosittu sato ja orjakauppa oli nousussa. Afrikkalaisia orjia käytettiin työvoimana monilla plantaaseilla, jotka täplittivät saarta. Lisäksi monet kauppiaat muilta saarilta tulivat St. Thomasiin ostamaan orjia. Vuosina 1691-1715 St. Thomasin väkiluku kasvoi 389 valkoisesta 547: ään ja 555 mustasta 3042: een.
vuonna 1717 St. Thomasista lähetettiin pieni joukko istutusmiehiä, orjia ja sotilaita vaatimaan St. Johnia. Kesäkuuta 1733 Tanskan Länsi-Intian kauppakomppania osti St. Croixin Ranskalta.
vuonna 1754 kuningas Frederik V hyväksyi ehdotuksen, jossa suositeltiin Tanskan hallituksen ottavan saarten hallinnon haltuunsa. Samoihin aikoihin St. Croix kasvoi nopeasti, ja sen väkiluku lähes kaksinkertaistui St. Thomasin ja St. Johnin yhteenlaskettuna. Pääkaupunki siirrettiin St. Thomasista Christianstediin St. Croixiin. Siinä missä St. Croix kehitti tyypillisen plantaasitalouden, St. Thomasin talous siirtyi kauppaan.
englantilaiset valtasivat Tanskan saaret vuonna 1801 noin vuodeksi ja uudelleen 1807-1815. Vaikka ensimmäinen valtaus ei jättänyt juurikaan pysyviä vaikutuksia, toinen aiheutti St. Thomasin kaupan pysähtymisen ja jätti joitakin istutuksia köyhtymään.
vapaasatama
St. Thomasista tehtiin vapaasatama vuonna 1815 ja seuraavina vuosina siitä tuli Länsi-Intian merenkulkukeskus ja jakelupiste. Charlotte Amalie kukoisti kaupallisesti. Suuret ja pienet tuontitalot, jotka kuuluivat englantilaisille, ranskalaisille, saksalaisille, italialaisille, amerikkalaisille, espanjalaisille, Sephardimilaisille ja tanskalaisille omistajille, kukoistivat. Suuri osa kaikesta Länsi-Intian kaupasta kanavoitiin sataman kautta. 14 000 asukkaasta monet olivat vapaita, vain noin 2 500 (enimmäkseen orjia) sai elantonsa plantaaseilla. Huomattava osa vapaista mustista työskenteli virkailijoina, kauppiaina ja käsityöläisinä. Väestö ja ilmakehä oli hyvin kosmopoliittinen, erityisesti verrattuna sen sisarsaareen St. Croixiin, jossa plantaasielämä oli normi. Juuri St. Croix ’ lla vuonna 1848 tapahtunut orjakapina johti orjuuden lakkauttamiseen Tanskan Länsi-Intiassa.
höyrylaivojen lisääntyessä 1840-luvulla St. Thomas jatkoi eteenpäin tulemalla etelä-ja Pohjois-Amerikan välillä kulkevien laivojen hiiliasemaksi. Shipping lines teki Charlotte Amaliesta päämajansa. Myöhemmät edistysaskeleet Steamissa ja poliittisessa ilmapiirissä mahdollistivat Espanjan ja Englannin saarten tuonnin suoraan tuottajilta, joten St. Thomasin jättäminen väliin. 1860-luvulle tultaessa häämötti hyvinvoinnin loppu. Coaling kuitenkin jatkuisi noin 1935. Hiililaivojen miehitys oli pitkälti naisten täyttämä.
1800-luvun lopulla
1800-luvun lopulla ja 1900-luvun alussa useat suuret luonnonkatastrofit kuten hirmumyrskyt, tulipalot ja tsunami jättivät Charlotte Amalien kaipaamaan suuria uudelleenrakennuksia. Kului vuosia ennen kuin vanhat varastorakennukset, joissa aikoinaan säilytettiin tavaroita kaupankäyntiä varten, rakennettiin uudelleen, jotta katuja reunustavat hienot putiikit ja kaupat pystyttäisiin rakentamaan. St. Croix ’ lla plantaasit kärsivät työongelmista ja sokerin alhaisista markkinahinnoista. Tanskan Länsi-Intia tuli yhä riippuvaisemmaksi Tanskasta ja sen valtiovarainministeriöstä näinä vaikeina aikoina.
neuvottelut Yhdysvaltain ja Tanskan välillä aloitettiin useaan otteeseen vuosina 1865-1917, jolloin lopullinen kauppa solmittiin ja Yhdysvallat osti Tanskan Länsi-Intian 25 miljoonalla dollarilla.
”Amerikan Neitsytsaaret”
Yhdysvaltain lippu nostettiin kolmella ”Amerikan Neitsytsaarella” 31.Maaliskuuta 1917. Saaret pysyivät Yhdysvaltain laivaston hallinnassa vuoteen 1931 saakka; tuona aikana toteutettiin useita merkittäviä julkisia töitä ja sosiaalisia uudistushankkeita. Kuvernöörejä nimitettiin vuodesta 1931 vuoteen 1969, jolloin ensimmäinen vaaleilla valittu kuvernööri astui virkaan. Saariryhmän pääkaupunki on Charlotte Amalie St. Thomasin varrella.
lento-ja merimatkailun lisääntyessä 1950-luvulla vauraus palasi Charlotte Amalieen ja St. Thomasiin. Turismi jatkoi kasvuaan seuraavina vuosina. Saaren väkiluku kasvoi, kun muilta Karibian saarilta tuli siirtolaisia, jotka toivoivat löytävänsä työtä kehittyvältä matkailuteollisuudelta.
St. Thomas muutti 21. vuosisadalle säilyttäen asemansa yhtenä Karibian suosituimmista lomakohteista ja Charlotte Amalie suosikkiristeilijäsatamana.