innan ”Virginia Rebellion” (som det kom att kallas) började på allvar 1674 krävde vissa friägare vid Virginia-gränsen att indianer, inklusive de i vänliga stammar som bor på fördragsskyddade länder, skulle drivas ut eller dödas. Den kombinerade avsmaken för den indiska befolkningen i Virginia är en mycket diskuterad katalysator för Bacons uppror, eftersom upproret handlade lika mycket om ”våldsamt indianer” och ”det hatet” som det handlade om brittisk gränspolitik. De protesterade också mot korruption i guvernör Berkeleys regering, som har beskrivits som ”oförbätterligt korrupt, omänskligt förtryckande och oerhört ineffektivt, särskilt i krig”.
före Bacons uppror inrättade Anglo-Powhatan Wars den distinkta hierarkiska separationen och själviskheten mellan indianerna och Virginierna som så småningom skulle formas till grunden för att dämpa indianerna under Bacons uppror. Efter en razzia av Doeg-indianer i Stafford County, Virginia, där två vita män dödades i samband med en näringsidkare som heter Mathews (som senare rapporter fann regelbundet ”lurade och misshandlade” indianer), en grupp Virginia-milismän plundrade bosättningar av Susquehannock stam, istället för Doeg stam, inklusive några över Potomac River i Maryland. Maryland guvernör Calvert protesterade mot invasionen, och Susquehannocks svarade. Maryland milis gick sedan Virginia styrkor, och attackerade en befäst Susquehannock by. Efter att fem chefer hade accepterat Maryland-ledarens inbjudan till parley slaktades de, en åtgärd som provocerade senare lagstiftningsutredningar och tillrättavisningar. Susquehannocks svarade i kraft mot plantager och dödade 60 bosättare i Maryland och ytterligare 36 i deras första angrepp på Virginia Mark. Sedan gick andra stammar in, dödade bosättare, brände hus och fält och slaktade boskap så långt som James och York rivers.
Berkeley försökte undvika en större konflikt som liknar Kung Philips krig i New England och förespråkade inneslutning och föreslog byggandet av flera defensiva befästningar längs gränsen och uppmanade gränsbosättare att samlas i en defensiv hållning. Gräns bosättare avfärdade planen som dyr och otillräcklig, och misstänkte också att det kan vara en förevändning för att höja skattesatserna.
under tiden framträdde Bacon, vars övervakare på en James River-plantage hade dödats av indiska raiders, som en rebellledare. När Berkeley vägrade att ge Bacon en militärkommission för att attackera alla indianer, samlade Bacon sin egen styrka på 400-500 man och flyttade upp James River för att attackera Doeg och Pamunkey stammar. Även om båda i allmänhet hade levt fredligt med kolonisterna och inte hade attackerat gränsbosättningarna, var deras odlade Mark värdefulla.
i mars hade Berkeley försökt säkra krigare från Pamunkey-stammen för att bekämpa fientliga stammar enligt tidigare fördrag. Pamunkey queen Cockacoeske påminde passionerat Guvernörens råd om dödsfallet för 20 år sedan av sin man och 100 krigare som de hade tillhandahållit i en liknande situation. Ordföranden hade ignorerat hennes klagomål och fortsatte istället att kräva fler krigare och fick ett löfte i gengäld för att leverera ett dussin. Berkeley arresterade Bacon och tog bort honom från rådet, men Bacons män säkrade snabbt hans frisläppande och tvingade Berkeley att hålla lagstiftningsval. Under tiden fortsatte Bacons män sin offensiv mot Pamunkeys, som flydde in i Dragon Swamp. När den vänliga Occoneechee lyckades fånga ett Susquehannock fort krävde Bacons styrkor alla bytet, även om de inte hade hjälpt till i striderna. De attackerade sedan Oconeechee genom förräderi och dödade män, kvinnor och barn.
trots Bacons olagliga status valde väljarna i Henrico County honom till det ombyggda House of Burgesses. Det organet antog ett antal genomgripande reformer, begränsade guvernörens befogenheter och återställde rösträtten till landlösa frimän. De gjorde också försäljningen av vapen till någon Indisk bestraffas med dödsstraff. Bacons anhängare var omollifierade och anklagade Berkeley för att vägra att godkänna vedergällning mot infödda för att skydda sina egna pälshandelsinvesteringar och de monopol som han hade beviljat sina favoriter. Efter ett antal verbala bråk, inklusive ett gräl på en Jamestown-gata, drog Berkeley sig tillbaka till sin plantage och undertecknade militärkommissionen Bacon krävde. Scouting parter följaktligen anges att rekvisition leveranser, liksom att döda och förslava indianer, föranledde protester från medborgare i Gloucester County som var föremål för milisen ’ s exaktioner. Bacons styrkor drog sig tillbaka till Middle Plantation (senare bytt namn till Williamsburg).
den 30 juli 1676 utfärdade Bacon och hans provisoriska army en deklaration av folket, som kritiserade Berkeleys administration, anklagade honom för att ta ut orättvisa skatter, utse vänner till höga positioner och misslyckas med att skydda avlägsna bönder från Indisk attack. De utfärdade också ett ” manifest ”som uppmanade utrotningen av alla indianer och hävdade att de inte förtjänade rättsligt skydd eftersom de”har bin i dessa många år fiender till kungen och landet, rånare och tjuvar och inkräktare av Hans Majestäts rätt och vårt intresse och egendom”. Månader av konflikt följde, inklusive ett marinförsök över Potomac och i Chesapeake Bay av Bacons allierade att fånga Berkeley på Accomac. Bacon själv fokuserade på Pamunkey i Dragon Swamp; hans styrkor grep 3 hästlaster av varor, förslavade 45 indianer och dödade många fler, vilket fick drottningen Cockacoeske (som smalt flydde med sin son) att kasta sig på guvernörens råd. Berkeley tog upp sin egen legosoldat på östra stranden och fångade också Bacons marinallierade och avrättade de två ledarna. Bacons styrkor vände sig sedan mot kolonins huvudstad och brände Jamestown till marken den 19 September 1676.
innan en engelsk sjöskvadron kunde komma, Dog Bacon av dysenteri den 26 oktober 1676. Även om John Ingram tog kontroll över rebellstyrkorna kollapsade upproret snart. Guvernör Berkeley återvände till makten, beslagtog flera rebellers egendom och slutligen hängde tjugotre män, många utan rättegång. Efter att en utredningsutskott returnerade sin rapport till kung Charles II och kritiserade både Berkeley och Bacon för deras uppförande mot vänliga stammar, befriades Berkeley från guvernörskapet, återvände till England för att protestera och dog kort därefter. Charles II kommenterade senare, ” den gamla dåren har dödat fler människor i det nakna landet än jag gjorde här för mordet på min far.”Detta kan vara en kolonial myt som uppstår ungefär 30 år senare.