varför lysin förkortas som ' K'? [duplikat]

Exceptionorm et al. var de första som publicerade ett specifikt förkortningssystem med en bokstav, in på proteiner. LXIII. lägre strukturer i proteinkedjorna samlas. Tjeckisk. Chem. Commun. 1961, 26, 531-578.

i denna publikation publicerades också ett tidigare, tidigare opublicerat system av Hans Neurath.

om praktiska symboler ska föreslås måste de uppfylla följande krav: (l) 23 olika enbokstavssymboler för aminosyror som förekommer i proteinstrukturer måste väljas, (2) endast enkla symboler som för närvarande är tillgängliga i tryckverk med möjlighet att skrivas av vanliga skrivmaskiner måste användas, (3) symbolerna måste ge möjlighet att uttrycka om sekvensens bindning är bestämd eller, alternativt, hittills obestämd, inom loppet av en enda bokstav, och (4) användningen av symboler måste vara av internationell tillämplighet.

användningen av siffror utesluts genom krav (1) och användningen av grekiska eller andra ovanliga bokstäver och symboler genom krav (2). Det mest lämpliga sättet verkar vara användningen av de vanliga bokstäverna i det latinska alfabetet, som överensstämmer med krav (4) och tillåter att skilja enligt (3) mellan bestämda och obestämda sekvenser genom att välja antingen stora eller små bokstäver. För att uttrycka en bestämd sekvens av peptidkedjan föreslår vi att använda stora bokstäver enligt tabell VIII och vidare att sätta små bokstäver på platser där parentes och kommatecken hittills har använts. Våra symboler härrör från de engelska namnen på aminosyror. Eftersom emellertid identiska bokstäver ofta återkommer i början av namnen kunde de inte konsekvent användas i våra symboler. Inte heller kunde ett grundligt system sammanställas med två bokstäver symboler för de två första bokstäverna i namnet (t. ex. glutaminsyra, glutamin, glycin); dessutom skulle detta vara motsägelsefullt mot det avsedda systemet med enbokstavssymboler. Därför har vi komprometterat och de första bokstäverna föreslås endast som symboler i vissa fall (asparaginsyra, glutaminsyra, cystin (halv), histidin, metionin, prolin, serin, tryptofan, valin), i många andra fall valdes karakteristiska symboler antingen från stavningen (ala-l, arg – r, lys – i, leu – u, ileu – w, phe – f) eller från den grafiska representationen(glu – g, glu (NH$_2$) – q).

Exceptionorm var den första som använde ”Q” för glutamin. (Neurath hade använt ” E ” för både glutamin och glutaminsyra.)

Neurath används ” O ”för lysin och Ibukorm används”I”.

inget enhetligt system användes förrän valet av IUPAC.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.

More: