proteiner är relativt stora och komplexa molekyler som är väsentliga för livet. De klassificeras som biomolekyler-tillsammans med kolhydrater och DNA och RNA, andra molekyler som är nödvändiga för livet.
proteiner är i huvudsak polymerer – det vill säga de består av vissa byggstenar som helt enkelt används om och om igen längs molekylens kedja, i detta fall protein. Dessa byggstenar, eller monomerer, i fallet med proteiner är molekyler som kallas aminosyror. Genom att bryta ner detta namn kan det härledas vad det är gjord av – amino hänvisar till aminogruppen (-NH2) och syra till karboxylsyragruppen (-COOH).
amino är en bas, medan COOH är en syra. Aminogruppen kan protoneras till form-NH3+. Under tiden kan syragruppen, COOH, deprotoneras för att bilda konjugatbasen-COO-. Aminosyror vid fysiologiskt pH (cirka 7) kommer att ha denna form. De är neutrala men innehåller lika många positiva och negativa laddningar – de är zwitterioner.
dessa två funktionella grupper är anslutna till ett centralt alfa-kol. Det finns 20 aminosyror som är nödvändiga för livet. Av dessa 20 har 19 ett kiralt alfa-kol. Närvaron av detta kirala centrum gör aminosyror asymmetriska och är inte överlagbara med sina spegelbilder. Enkelt uttryckt kommer ett kol att vara kiralt om det är kopplat till fyra unika grupper. Som nämnts är 19 av de essentiella aminosyrorna kirala och har därför ett centralt alfa-kol fäst vid 4 olika grupper. De två första grupperna är de två huvudsakliga funktionella grupperna som utgör aminosyror. De andra två är 1) ett väte och 2) en R-grupp som kallas en sidokedja. Den enda aminosyran som inte har ett kiralt kol är glycin, eftersom R-gruppen är ett annat väte.
hittills är det uppenbart att aminosyror består av atomer av kol (C), väte (H), syre (O) och kväve (N). I själva verket utgör detta de flesta proteiner. Den enda andra atomen som kan hittas i proteiner är svavel (er) och den är närvarande i sidokedjan av två aminosyror, nämligen cystein och metionin.
i korthet består proteiner av monomerer som kallas aminosyror. Dessa aminosyror är molekyler som består av atomer av kol, väte, kväve, syre och i vissa fall svavel. Aminosyror, monomererna, är anslutna via peptidbindningar för att bilda polymeren som är proteinet.