Amphipathic-lipide-Packing-Sensor Interacțiuni cu lipide evaluate de atomistic molecular dynamics

motivul Amphipathic-lipide-Packing-Sensor (ALPS) vizează proteina arfgap1 la membranele curbate în timpul formării veziculelor în aparatul Golgi. ALPS recunoaște în mod specific defectele de ambalare a lipidelor datorită curburii pozitive a veziculelor în devenire. În această lucrare am evaluat interacțiunile microscopice dintre ALPS și două membrane fosfolipidice la diferite grade de ambalare a lipidelor prin dinamica moleculară explicită (MD). Simulările au fost efectuate în membrane slab ambalate compuse dintr-un amestec de dioleoilfosfatidilcolină (DOPC)/dioleoilglicerol (câine) la un raport molar 85:15. Alte simulări au fost efectuate în DOPC pur pentru care ambalarea lipidelor este mai strânsă. Arătăm că prezența câinelui provoacă defecte de ambalare la nivelul fosfatului și, prin urmare, modifică unele proprietăți ale bistratului. Aceasta duce la o hidratare mai mare a capului lipidicgrupuri. Când este încorporat într-o membrană cu astfel de defecte, ALPS prezintă un grad mai mare de flexibilitate conformațională decât într-o membrană mai ambalată. Propunem ca detectarea ambalării lipidelor de către ALPS să aibă o origine entropică și că flexibilitatea sa este o caracteristică cheie.

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.

More: