amfipathisch-lipide-verpakking-Sensor interacties met lipiden bepaald door atomistische moleculaire dynamica

het amfipathisch-lipide-verpakking-Sensor (ALPS) motief richt het eiwit ArfGAP1 op gebogen membranen tijdens de vorming van blaasjes in het Golgi-apparaat. ALPS herkent specifiek lipide verpakkingsdefecten als gevolg van de positieve kromming van ontluikende blaasjes. In dit werk hebben we de microscopische interacties tussen Alpen en twee fosfolipide membranen in verschillende mate van lipide verpakking door expliciete moleculaire dynamica (MD) onderzocht. Simulaties werden uitgevoerd binnen losjes verpakte membranen bestaande uit een mengsel van dioleoylfosfatidylcholine (DOPC)/dioleoylglycerol (hond) in een molaire verhouding 85:15. Enkele andere simulaties werden uitgevoerd in pure DOPC waarvoor de lipidenverpakking strakker is. We tonen aan dat de aanwezigheid van honden verpakkingsfouten veroorzaakt op het fosfaatniveau en daardoor bepaalde eigenschappen van de dubbellaag wijzigt. Dit leidt tot een hogere hydratatie van de lipide hoofdgroepen. Wanneer ingebed in een membraan met dergelijke defecten, ALPS vertoont een hogere mate van conformationele flexibiliteit dan in een meer verpakte membraan. Wij stellen voor dat de detectie van lipidenverpakkingen door Alpen een entropische oorsprong kan hebben en dat de flexibiliteit daarvan een belangrijk kenmerk is.

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.

More: