Amfipaattinen-Lipidipakkausanturi-vuorovaikutukset lipidien kanssa arvioituna atomistisella molekyylidynamiikalla

Amfipaattinen-Lipidipakkausanturi (ALPS)-motiivi kohdistaa arfgap1-proteiinin kaareviin kalvoihin rakkuloiden muodostuessa Golgi-laitteessa. Alpit tunnistavat erityisesti lipidipakkausvirheet, jotka johtuvat orastavien vesikkelien positiivisesta kaarevuudesta. Tässä työssä arvioimme mikroskooppisia vuorovaikutuksia Alppien ja kahden fosfolipidikalvon välillä lipidipakkauksen eri asteilla eksplisiittisen molekyylidynamiikan (MD) avulla. Simulaatiot suoritettiin väljästi pakatuilla kalvoilla, jotka koostuivat dioleoyylifosfatidyylikoliinin (DOPC) ja dioleoyyliglyserolin (koira) seoksesta moolisuhteessa 85:15. Joitakin muita simulaatioita tehtiin puhtaalla DOPC: llä, jolle lipidipakkaus on tiukempi. Osoitamme, että koiran läsnäolo aiheuttaa pakkausvirheitä fosfaattitasolla ja siten muuttaa joitakin kaksikerroksisen ominaisuuksia. Tämä johtaa rasva-pääryhmien suurempaan nesteytykseen. Kun Alpit on upotettu kalvoon, jossa on tällaisia vikoja, ne ovat mukautuvampia kuin pakkautuneemmat kalvot. Ehdotamme, että Alpeilla havaituilla lipidipakkauksilla voi olla entropista alkuperää ja että niiden joustavuus on keskeinen piirre.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.

More: