Amphipathic-Lipid-Packing-Sensor interaktioner med lipider bedömda av atomistic molecular dynamics

Amphipathic-Lipid-Packing-Sensor (ALPS) motiv riktar proteinet ArfGAP1 till böjda membran under vesikelbildning i Golgi-apparaten. Alperna känner specifikt igen lipidförpackningsdefekter på grund av den positiva krökningen hos spirande vesiklar. I detta arbete bedömde vi de mikroskopiska interaktionerna mellan Alperna och två fosfolipidmembran vid olika grader av lipidpackning med explicit molekyldynamik (MD). Simuleringar utfördes inom löst packade membran bestående av en blandning av dioleoylfosfatidylkolin (DOPC)/dioleoylglycerol (hund) i ett molförhållande 85:15. Några andra simuleringar utfördes i ren DOPC för vilken lipidpackning är stramare. Vi visar att närvaron av hund orsakar packningsfel på fosfatnivån och därigenom modifierar vissa egenskaper hos dubbelskiktet. Detta leder till en högre hydrering av lipidhuvudetgrupper. När den är inbäddad i ett membran med sådana defekter visar ALPS en högre grad av konformationsflexibilitet än i ett mer packat membran. Vi föreslår att lipidpackningsavkänning av Alperna kan ha ETT entropiskt ursprung och att dess flexibilitet är en nyckelfunktion.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.

More: