Amphipathic-Lipid-Packing-Sensor interaktioner med lipider vurderet ved atomistisk molekylær dynamik

amphipathic-Lipid-Packing-Sensor (ALPS) motivet retter sig mod proteinet ArfGAP1 til buede membraner under dannelse af vesikler i Golgi-apparatet. Alperne genkender specifikt lipidpakningsfejl på grund af den positive krumning af spirende vesikler. I dette arbejde vurderede vi de mikroskopiske interaktioner mellem Alperne og to phospholipidmembraner ved forskellige grader af lipidpakning ved eksplicit molekylær dynamik (MD). Simuleringer blev udført inden for løst pakkede membraner sammensat af en blanding af dioleoylphosphatidylcholin (DOPC)/dioleoylglycerol (hund) i et molforhold 85:15. Nogle andre simuleringer blev udført i ren DOPC, for hvilken lipidpakning er strammere. Vi viser, at tilstedeværelsen af hund forårsager pakningsfejl på fosfatniveauet og derved ændrer nogle egenskaber af dobbeltlaget. Dette fører til en højere hydrering af lipidhovedgrupperne. Når Alperne er indlejret i en membran med sådanne defekter, viser de en højere grad af konformationsfleksibilitet end i en mere pakket membran. Vi foreslår, at lipid packing sensing af ALPS kan have en entropisk oprindelse, og at dens fleksibilitet er en nøglefunktion.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.

More: