amphipathic-Lipid-Packing-Sensor interactions with lipids assessed by atomistic molecular dynamics

motyw Amphipathic-Lipid-Packing-Sensor (ALPS) kieruje białko ArfGAP1 do zakrzywionych błon podczas tworzenia pęcherzyków w aparacie Golgiego. ALPS szczególnie rozpoznaje wady pakowania lipidów ze względu na dodatnią krzywiznę pączkujących pęcherzyków. W pracy oceniono mikroskopowe interakcje między ALPS i dwoma błonami fosfolipidowymi w różnym stopniu pakowania lipidów za pomocą explicit molecular dynamics (MD). Symulacje przeprowadzono w luźno upakowanych błonach składających się z mieszaniny dioleoilofosfatydylocholiny (DOPC)/dioleoiloglicerolu (DOG) w stosunku molowym 85:15. Niektóre inne symulacje przeprowadzono w czystym DOPC, dla których pakowanie lipidów jest ściślejsze. Pokazujemy, że obecność psa powoduje wady opakowania na poziomie fosforanu, a tym samym modyfikuje niektóre właściwości dwuwarstwy. Prowadzi to do wyższego nawodnienia grup lipidowych. Po osadzeniu w membranie z takimi wadami, ALPS wykazuje wyższy stopień elastyczności konformacyjnej niż w membranie bardziej zapakowanej. Proponujemy, że wykrywanie opakowań lipidowych przez ALPS może mieć pochodzenie entropowe, a jego elastyczność jest kluczową cechą.

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.

More: