Amphipathic-Lipídios-Embalagem-Sensor de interações com lipídios avaliado por atomizado dinâmica molecular

O Amphipathic-Lipídios-Embalagem-Sensor (ALPES) motivo de metas a proteína ArfGAP1 curvas membranas durante a formação de vesículas do aparelho de Golgi. Os Alpes reconhecem especificamente defeitos de embalagem lipídica devido à curvatura positiva das vesículas em flor. Neste trabalho avaliamos as interações microscópicas entre Alpes e duas membranas fosfolípidas em diferentes graus de embalagem lipídica por Dinâmica molecular explícita (MD). Foram realizadas simulações em membranas pouco embaladas compostas por uma mistura de dioleoilfosfatidilcolina (DOPC)/dioleoilglicerol (cão) com uma razão molar de 85:15. Algumas outras simulações foram realizadas em puro DOPC para o qual o empacotamento lipídico é mais apertado. Mostramos que a presença de cães provoca defeitos de empacotamento ao nível do fosfato e, assim, modifica algumas propriedades do bilayer. Isto leva a uma hidratação mais elevada dos grupos lipídicos. Quando embutidos em uma membrana com tais defeitos, os Alpes exibem um maior grau de flexibilidade conformacional do que em uma membrana mais embalada. Propomos que a detecção de embalagens lipídicas pelos Alpes possa ter uma origem entrrópica e que a sua flexibilidade seja uma característica fundamental.

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