atomistic分子動力学によって評価される脂質との両親媒性脂質パッキンセンサー相互作用

両親媒性脂質パッキンセンサー(ALPS)モチーフは、ゴルジ装置における小胞形成中にタンパク質Arfgap1を湾曲した膜に標的とする。 ALPSは、出芽小胞の正の曲率による脂質パッキング欠陥を特異的に認識する。 本研究では、明示的な分子動力学(MD)によって脂質パッキングの異なる程度でALPSと二つのリン脂質膜の間の顕微鏡的相互作用を評価した。 シミュレーションは、モル比85:15でジオレオイルホスファチジルコリン(DOPC)/ジオレオイルグリセロール(犬)の混合物からなる緩く充填膜内で行われた。 脂質パッキングがよりタイトである純粋なDOPCでいくつかの他のシミュレーションを行った。 DOGの存在はりん酸レベルでパッキング欠陥を引き起こし,それによって二重層のいくつかの特性を修飾することを示した。 これは脂質のheadgroupsのより高い水和の原因となります。 このような欠陥を有する膜に埋め込まれた場合、ALPSは、より充填された膜よりも高い立体配座柔軟性を示す。 ALPSによる脂質パッキンセンシングはエントロピー起源を有し,その柔軟性が重要な特徴であることを提案した。

コメントを残す

メールアドレスが公開されることはありません。

More: