condițiile de la bordul navei în timpul pasajului de mijloc erau îngrozitoare. Bărbații erau împachetați sub punte și erau asigurați cu fiare de călcat. Spațiul era atât de înghesuit încât au fost forțați să se ghemuiască sau să se întindă. Femeile și copiii erau ținuți în camere separate, uneori pe punte, permițându-le libertatea de mișcare limitată, dar acest lucru le-a expus și violenței și abuzurilor sexuale din partea echipajului.
aerul din cală era murdar și putred. Răul de mare era comun, iar căldura era apăsătoare. Lipsa de salubritate și condițiile sufocante au însemnat că există o amenințare constantă de boală. Epidemiile de febră, dizenterie (fluxul) și variolă au fost frecvente. Captivii au îndurat aceste condiții timp de aproximativ două luni, uneori mai mult.
pe vreme bună, captivii au fost aduși pe punte în mijlocul dimineții și forțați să facă exerciții fizice. Erau hrăniți de două ori pe zi, iar cei care refuzau să mănânce erau hrăniți cu forța. Cei care au murit au fost aruncați peste bord.
combinația dintre boală, hrană inadecvată, rebeliune și pedeapsă a avut un impact puternic asupra captivilor și echipajului deopotrivă. Înregistrările supraviețuitoare sugerează că până în anii 1750 unul din cinci Africani la bordul navei a murit.
unele guverne europene, cum ar fi britanicii și francezii, au introdus legi pentru a controla condițiile de la bord. Au redus numărul de persoane permise la bord și au necesitat transportul unui chirurg. Principalul motiv pentru a lua măsuri a fost preocuparea pentru echipaj și nu pentru captivi.
chirurgii, deși adesea necalificați, au fost plătiți cu bani de cap pentru a menține captivii în viață. În jurul anului 1800, înregistrările arată că numărul africanilor care au murit a scăzut la aproximativ unul din optsprezece.