Amphipathic-Lipid-Balení-Senzor interakce s lipidy hodnotí rozdrobená molekulární dynamiky,

Amphipathic-Lipid-Balení-Senzor (ALPY) motiv se zaměřuje na bílkoviny ArfGAP1 na zakřivené membrány při tvorbě váčků v Golgiho aparátu. ALPS specificky rozpoznává defekty lipidového balení v důsledku pozitivního zakřivení začínajících vezikul. V této práci jsme hodnotili mikroskopické interakce mezi ALPS a dvěma fosfolipidovými membránami při různých stupních balení lipidů pomocí explicitní molekulární dynamiky (MD). Simulace byly provedeny ve volně balených membránách složených ze směsi dioleoylfosfatidylcholinu (DOPC)/dioleoylglycerolu (DOG) v molárním poměru 85: 15. Některé další simulace byly provedeny v čistém DOPC, pro které je lipidové balení těsnější. Ukazujeme, že přítomnost psa způsobuje defekty balení na úrovni fosfátů a tím modifikuje některé vlastnosti dvojvrstvy. To vede k vyšší hydrataci lipidových skupin. Když je vložen do membrány s takovými defekty, ALPS vykazuje vyšší stupeň konformační flexibility než ve více zabalené membráně. Navrhujeme, aby snímání lipidových obalů pomocí ALPS mohlo mít entropický původ a že jeho flexibilita je klíčovým prvkem.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.

More: