Le roi d’Eswatini, Mswati II, a invité des missionnaires chrétiens méthodistes dans son royaume en 1825. La première église à être établie dans le pays a été la Mission méthodiste Wesleyenne établie à Mahamba en 1844. Les missions chrétiennes échouèrent en grande partie jusqu’en 1881 et eurent peu de conversions à leur actif. Une plus grande présence de missionnaires a commencé en 1881 lorsque des membres de la Société unie sont arrivés pour établir la présence de l’Église d’Angleterre. Les luthériens sont arrivés en 1887 d’Allemagne, et les méthodistes ont repris leurs efforts en 1895 à partir de leurs missions chrétiennes en Afrique du Sud.
Une église de style gothique, construite en 1912, se trouve toujours à Mahamba et est le plus ancien lieu de culte existant dans le pays.Une grande présence catholique romaine, y compris des églises, des écoles et d’autres infrastructures, existe dans le pays. Le pays forme un seul diocèse – le diocèse de Manzini. Les Églises sionistes, qui mélangent le christianisme et le culte ancestral autochtone, et se sont développées au début du XIXe siècle, prédominent dans les zones rurales. Les fêtes chrétiennes telles que le Vendredi Saint, Noël et l’Ascension font partie du calendrier des fêtes nationales.
Le christianisme suivi par les Swazis incorpore des rituels, des chants, des danses et une iconographie de la religion traditionnelle swazie. Selon Sibongile Nxumalo, les missionnaires chrétiens qui ont ignoré ou mal interprété « les aspects positifs des croyances traditionnelles, des coutumes et des institutions de la société swazie » ont largement échoué. Les missions les plus réussies ont adopté une approche syncrétique.
Les organisations chrétiennes d’Eswatini ont été étroitement impliquées dans la politique du pays. La Ligue des Églises africaines du Swaziland de l’époque coloniale a eu une longue relation avec la royauté d’Eswatini et a organisé des cérémonies publiques telles que Pâques au nom du Roi. Les églises sionistes célèbrent le Vendredi Saint pendant trois jours avec des chants et des danses. La Conférence des Églises d’Eswatini a toujours tenté d’être apolitique, mais en 2004, elle a fait campagne pour faire du christianisme la religion d’État par un amendement constitutionnel, une décision à laquelle le roi s’est opposé. La troisième organisation chrétienne politiquement influente en Eswatini a été le Conseil des Églises d’Eswatini, créé en 1976 alors que les réfugiés affluaient en Eswatini, et ce groupe a exprimé son point de vue sur l’apartheid en Afrique du Sud et la guerre civile en cours au Mozambique voisin. Leurs opinions contredisaient la position de l’État et les dirigeants de ce nouveau Conseil étaient alors menacés d’arrestations et de peines de prison.