Amfipatikus-Lipid-csomagoló-érzékelő kölcsönhatások lipidekkel atomisztikus molekuláris dinamikával értékelve

az Amfipatikus-Lipid-csomagoló-érzékelő (ALPS) motívum az ArfGAP1 fehérjét ívelt membránokra célozza meg a vezikulum kialakulása során a Golgi készülékben. Az ALPS kifejezetten felismeri a lipidcsomagolási hibákat a kezdő vezikulák pozitív görbülete miatt. Ebben a munkában az ALPS és két foszfolipid membrán közötti mikroszkopikus kölcsönhatásokat vizsgáltuk különböző fokú lipidcsomagolásban explicit molecular dynamics (MD) segítségével. A szimulációkat lazán csomagolt membránokon végeztük, amelyek dioleoil-foszfatidilkolin (DOPC)/dioleoil-glicerin (DOG) keverékéből álltak 85:15 mólarányban. Néhány más szimulációt tiszta DOPC-ben végeztünk, amelynél a lipidcsomagolás szorosabb. Megmutatjuk, hogy a kutya jelenléte csomagolási hibákat okoz a foszfát szintjén, ezáltal módosítja a kétréteg egyes tulajdonságait. Ez a lipid fejcsoportok magasabb hidratációjához vezet. Ilyen hibákkal rendelkező membránba ágyazva az ALPS nagyobb fokú konformációs rugalmasságot mutat, mint egy tömöttebb membránban. Javasoljuk, hogy az ALPS által végzett lipidcsomagolás-érzékelés entrópikus eredetű lehet, és rugalmassága kulcsfontosságú jellemző.

Vélemény, hozzászólás?

Az e-mail-címet nem tesszük közzé.

More: