Amphipathic-Lipid-Pakking-Sensor interaksjoner med lipider vurdert av atomistic molecular dynamics

Den Amphipathic-Lipid-Pakking-Sensor (ALPS) motiv mål proteinet ArfGAP1 til buede membraner under vesikkel dannelse I Golgi apparatet. ALPS gjenkjenner spesifikt lipidpakningsfeil på grunn av den positive krumningen av spirende vesikler. I dette arbeidet vurderte vi de mikroskopiske interaksjonene MELLOM ALPENE og to fosfolipidmembraner i forskjellige grader av lipidpakking ved eksplisitt molekylær dynamikk (MD). Simuleringer ble utført i løst pakkede membraner sammensatt av en blanding av dioleoylfosfatidylkolin (DOPC)/dioleoylglycerol (HUND) i et molforhold 85:15. Noen andre simuleringer ble utført i ren DOPC for hvilken lipidpakking er strammere. Vi viser at TILSTEDEVÆRELSEN AV HUND forårsaker pakkefeil på fosfatnivået og dermed endrer noen egenskaper av dobbeltlaget. Dette fører til høyere hydrering av lipidhodetgrupper. Når det er innebygd i en membran med slike feil, VISER ALPENE en høyere grad av konformasjonsfleksibilitet enn i en mer pakket membran. Vi foreslår at lipid pakking sensing AV ALPENE kan ha en entropisk opprinnelse og at fleksibiliteten er en viktig funksjon.

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.

More: