Den Første og Andre republikkene
Splid og vold har markert Burundi siden uavhengigheten. Selv om blodsutgytelse ikke har skjedd på skalaen sett I Rwanda, etnisk konflikt har resultert i hundretusener av dødsfall og hundretusener av mennesker blir fordrevet fra sine hjem. Den første hendelsen skjedde ikke før i januar 1965, Da Pierre Ngendandumwe, En Hutu, tiltrådte som statsminister for andre gang, på anmodning fra den konstitusjonelle monarken, Mwami Mwambutsa. Ngendandumwe ble myrdet av En Tutsi drapsmann januar 15, før han hadde en sjanse til å etablere en regjering. Joseph Bamina, en Annen Hutu, tjente da som statsminister til valg kunne holdes senere samme år. Selv om valget ga Hutu et klart flertall av seter I Nasjonalforsamlingen, ignorerte Mwambutsa resultatene og utnevnte En Tutsi-Lé Biha, hans private sekretær—statsminister. Mwambutsa insisterte på at makten ville fortsette å hvile med kronen, selv når han valgte å forlate landet etter et mislykket kupp ledet av en gruppe hutu offiserer i oktober; han bestemte at hans sønn, Prins Charles Ndizeyeto, skulle herske i hans fravær.
Kontroll Over Burundi falt helt i Hendene På Tutsier før slutten av neste år. Etter det mislykkede kuppet ble rundt 34 hutuoffiserer henrettet, Og Tutsi-kontrollen ble ytterligere styrket da Michel Micombero ble utnevnt til statsminister i juli 1966. En Tutsi-Bahima fra bururi-provinsen, Micombero hadde spilt en nøkkelrolle i å hindre kuppet i 1965 og i å organisere anti-Hutu opptøyer på landsbygda. Også i juli 1966 ble Mwambutsa avsatt av sin sønn, som begynte det som skulle bli et ekstremt kort styre, da han selv ble avsatt av Tutsi-politikere i November. Etter at monarkiet ble styrtet og Den formelle proklamasjonen Av Den Første Republikken (Med Micombero som president), ble Det siste hinderet For Tutsi-dominansen fjernet.
Ingen annen hendelse kastet større vanry på Den Første Republikken enn folkemord drapene begått mot hutu samfunnet i April Og Mai 1972. Selv om hutu i utgangspunktet drepte rundt 2000 Tutsier, ble det til slutt antatt at 100 000 til 200 000 Hutuer ble drept, samt ytterligere 10 000 Tutsier. Blodbadet tok livet av ca 5 prosent av befolkningen og nesten eliminert alle utdannede hutuer, samt forårsaker mer enn 100.000 Hutuer å flykte fra landet. I tillegg til å skape dypt og varig hat på begge sider av det etniske skillet, ble hendelsene i 1972 kilden til betydelig spenning innen Tutsi-minoriteten, og banet dermed vei for å styrte Micombero i 1976 og ankomsten av Den Andre Republikken under presidentskapet Til Jean-Baptiste Bagaza. Selv om Han selv var En Tutsi-Bahima fra Bururi (som Micombero), Satte Bagaza ut for å gjenopplive UPRONA på en enestående skala. Samtidig ble alle anstrengelser gjort for å bringe Den Romersk-Katolske Kirke fast under statens kontroll, da Den Tutsi-kontrollerte regjeringen trodde kirkens politikk favoriserte Hutuene. Som et resultat av regjeringens innsats ble kirkens aktiviteter undertrykt.