Forholdene om bord på skipet under Midtpassasjen var forferdelige. Mennene ble pakket sammen under dekk og ble sikret med benjern. Plassen var så trangt at de ble tvunget til å crouch eller ligge ned. Kvinner og barn ble holdt i separate kvartalene, noen ganger på dekk, slik at de begrenset bevegelsesfrihet, men dette også utsatt dem for vold og seksuelle overgrep fra mannskapet.
luften i lasterommet var stygg og råtten. Sjøsyke var vanlig og varmen var undertrykkende. Mangelen på sanitære og kvelende forhold betydde at det var en konstant trussel om sykdom. Epidemier av feber, dysenteri (‘flux’) og kopper var hyppige. Fangene utholdt disse forholdene i ca to måneder, noen ganger lenger.
i godt vær ble fangene brakt på dekk midt på morgenen og tvunget til å trene. De ble matet to ganger om dagen, og de som nektet å spise ble tvangsforet. De som døde ble kastet over bord.
kombinasjonen av sykdom, utilstrekkelig mat, opprør og straff tok en tung avgift på fanger og mannskap. Fram til 1750-tallet døde en av Fem Afrikanere om bord.
Noen europeiske regjeringer, Som Britiske og franske, innførte lover for å kontrollere forholdene om bord. De reduserte antall personer som var tillatt om bord og krevde at en kirurg ble båret. Hovedgrunnen til å handle var bekymring for mannskapet og ikke fangene.
kirurgene, men ofte ukvalifiserte, ble betalt penger for å holde fangene i live. Ved rundt 1800 rapporter viser at antall Afrikanere som døde hadde gått ned til omtrent en i atten.